RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 TACC1O75410 805 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CSH1P0DML2 217 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CSH2P0DML3 217 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 GTF2H1P32780 548 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC142Q17RM4 750 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 PKMYT1Q99640 499 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 BCO2Q9BYV7 579 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 TASP1Q9H6P5 420 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 STX10O60499 249 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CD72P21854 359 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYP2F1P24903 491 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 LMO2P25791 158 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRT39Q6A163 491 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 STKLD1Q8NE28 680 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 TAF4BQ92750 862 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYLPFQ96A32 169 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 F5P12259 2224 aa20.49■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM170BA6NMN3 283 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 NCAM2O15394 837 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MBD3O95983 291 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDGFRBP09619 1106 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 P4HA1P13674 534 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAP1GAPP47736 663 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYP27A1Q02318 531 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDR2Q16832 855 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MLKLQ8NB16 471 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 IL21Q9HBE4 155 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 NME7Q9Y5B8 376 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 NCANO14594 1321 aa20.48■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP2C2O75185 946 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRRN2O75325 713 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANXA13P27216 316 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 AVPR1AP37288 418 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAGEA9P43362 315 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASPAP45381 313 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC35C1Q96A29 364 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 SDCBP2Q9H190 292 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAN2B1O00754 1011 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHADO15335 359 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM163BP0C2L3 166 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDH8P55286 799 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 NLRP12P59046 1061 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CBWD6Q4V339 395 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM171BQ6P995 826 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 NELL2Q99435 816 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 OBP2AQ9NY56 170 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.46■□□□□ 0.87
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIEZO1Q92508 2521 aa20.45■□□□□ 0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.45■□□□□ 0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 A8MXQ7 604 aa20.45■□□□□ 0.86
USP46-AS1-201ENST00000503051 GFRA3O60609 400 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms