RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478061.5

RBM28-204, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 3

Gene RBM28, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-204	ENST00000478061	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM28-204	ENST00000478061	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM28-204	ENST00000478061	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM28-204	ENST00000478061	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM28-204	ENST00000478061	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM28-204	ENST00000478061	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM28-204	ENST00000478061		F8VP50	259 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CALCA	P01258	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PAEP	P09466	180 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CD19	P15391	556 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PTPN2	P17706	415 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ADORA2B	P29275	332 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	GRIK1	P39086	918 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CLUH	O75153	1309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	TRIM66	O15016	1216 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	AP1G2	O75843	785 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	VDR	P11473	427 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	RFX1	P22670	979 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	EPHA5	P54756	1037 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	NR1I3	Q14994	352 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	SMO	Q99835	787 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061		O00370	1275 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CYP26A1	O43174	497 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	BEST1	O76090	585 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CSH1	P0DML2	217 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CSH2	P0DML3	217 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	MYL4	P12829	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	FSHR	P23945	695 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ANXA13	P27216	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	USP8	P40818	1118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CCR2	P41597	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	UBASH3A	P57075	661 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	TAF12	Q16514	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	PTPRD	P23468	1912 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061		A0A1W2PQC6	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	MOSPD3	O75425	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM28-204	ENST00000478061	NPR3	P17342	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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