RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-205ENST00000466861 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CCR2P41597 374 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 PTPN21Q16825 1174 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 GCNAQ96QF7 691 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 TWNKQ96RR1 684 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ARID3AQ99856 593 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 IL21Q9HBE4 155 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.75■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 DCXO43602 365 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CEBPBP17676 345 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 WEE1P30291 646 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 GPR15P49685 360 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 RAD23BP54727 409 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 LRMPQ12912 555 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 MIIPQ5JXC2 388 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 GAREM2Q75VX8 874 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 SHKBP1Q8TBC3 707 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 TCEAL4Q96EI5 215 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 MED10Q9BTT4 135 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 TTLL2Q9BWV7 592 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 COMMD8Q9NX08 183 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 F8VP50 259 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CLDN5O00501 218 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CAVIN2O95810 425 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 F11P03951 625 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 TPM2P07951 284 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 GABRR2P28476 465 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 TRIM65Q6PJ69 517 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 KCNK12Q9HB15 430 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 PNPLA8Q9NP80 782 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 FANCLQ9NW38 375 aa24.73■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 SMTNL1A8MU46 457 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 PAEPP09466 180 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 PPP3CCP48454 512 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CDR1P51861 262 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 HTR4Q13639 388 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 UBALD2Q8IYN6 164 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 C12orf29Q8N999 325 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.72■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 OBSL1O75147 1896 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 A0A1W2PRU2 124 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 AP1G2O75843 785 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 FAM200BP0CF97 657 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 CCDC130P13994 396 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF18P17022 549 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 TDGQ13569 410 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 NCAPHQ15003 741 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 NUP93Q8N1F7 819 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 GPR152Q8TDT2 470 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 ING5Q8WYH8 240 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 E2F7Q96AV8 911 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 MUTYHQ9UIF7 546 aa24.71■■□□□ 1.55
SUMO3-205ENST00000466861 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 ECI2O75521 394 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 PFKLP17858 780 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 PON1P27169 355 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 MFAP3P55082 362 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 ORC1Q13415 861 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 MTMR3Q13615 1198 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 TEAD2Q15562 447 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 ZNF394Q53GI3 561 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 ASB16Q96NS5 453 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 TASP1Q9H6P5 420 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 KRT82Q9NSB4 513 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 IL37Q9NZH6 218 aa24.7■■□□□ 1.54
SUMO3-205ENST00000466861 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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