RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCF4P15884 667 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YY1P25490 414 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN7P35236 360 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE4CQ08493 712 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRIK3Q13003 919 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MBTPS1Q14703 1052 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UPP1Q16831 310 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SENP8Q96LD8 212 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGS18Q9NS28 235 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFU1Q9UMS0 254 aa23.02■■□□□ 1.28
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TULP2O00295 520 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRCH4O75427 683 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC130P13994 396 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAX3P23760 479 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CETN2P41208 172 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTGIRP43119 386 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COPS2P61201 443 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WSCD1Q658N2 575 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFT81Q8WYA0 676 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLCO2A1Q92959 643 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSC2P49815 1807 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNM1LO00429 736 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RALAP11233 206 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK7P50613 346 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC27Q6P3X3 843 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JAMLQ86YT9 394 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMC1Q8N766 993 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.01■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT7P08729 469 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ECHS1P30084 290 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCNN1AP37088 669 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LHX1P48742 406 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGS7P49802 495 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRADDQ15628 312 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF169Q8NCN4 708 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA18Q8TC71 538 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERP44Q9BS26 406 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNPY3Q9BT09 278 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C9IYK1 514 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EOMESO95936 686 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCK1P35558 622 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJC1P36383 396 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DUPD1Q68J44 220 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UROC1Q96N76 676 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPYSL4O14531 572 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GABBR2O75899 941 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT1P04264 644 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPD1P21695 349 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADORA2BP29275 332 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACADSBP45954 432 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC6A3Q01959 620 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUSC3Q13454 348 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSFY1Q96LI6 401 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRCA2P51587 3418 aa22.99■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF8O76064 485 aa22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM189BP81408 668 aa22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms