RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPE3	YPR069C	YJL028W	P47062	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	YGL185C	P53100	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	DAD4	P69851	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	RTC6	O14464	93 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	HMX1	P32339	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	SPC25	P40014	221 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	TIM21	P53220	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	ADD37	Q03233	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	DAD1	Q12248	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU4	P53427	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	DPP1	Q05521	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	TIM22	Q12328	207 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	COX19	Q3E731	98 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	CYB5	P40312	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	EMC5	P40540	141 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	YDL183C	P48569	320 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	MGA1	P53050	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	ATP19	P81451	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	UPS3	Q04006	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU1	P0CE88	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU14	P0CE89	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU6	P0CE90	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU18	P0CE91	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU8	P0CE92	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU11	P0CE93	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	YCR023C	P25351	611 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU13	P38725	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	POG1	P40473	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU10	Q03050	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	ATG33	Q06485	197 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU20	Q08322	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	PAU9	Q3E770	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPE3	YPR069C	SHG1	P38337	142 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YIL163C	P40448	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YGR026W	P53217	278 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	DGA1	Q08650	418 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YFR045W	P43617	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	JAC1	P53193	184 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	DIA1	P54005	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	TIR1	P10863	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YPT53	P36019	220 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	SOH1	P38633	127 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	SUR2	P38992	349 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	PHO23	P50947	330 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	POF1	P25576	258 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	FZF1	P32805	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	PGD1	P40356	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	MRP10	O75012	95 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	UBC5	P15732	148 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	MOG1	P47123	218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	DIF1	O13577	133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	SEC59	P20048	519 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	SRP21	P32342	167 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YBR013C	P38215	129 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	YBR090C	P38253	122 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	TEM1	P38987	245 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPE3	YPR069C	SVP26	P38869	228 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	PMP3	P87284	55 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	BET5	Q03630	159 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	MSK1	P32048	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	MRP49	P32388	137 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	MIX23	P38162	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	YHR140W	P38842	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	RIB5	P38145	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	SRP14	P38985	146 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
SPE3	YPR069C	GPI19	Q04082	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	GIM5	Q04493	163 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	DXO1	Q06349	442 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	ERG28	P40030	148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	YIL059C	P40520	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPE3	YPR069C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66

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