RNA–Protein interactions for RNA: YOR069W

VPS5, Transcript of Nexin-1 homolog, yeast

Gene VPS5, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VPS5	YOR069W	SPC29	P33419	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YPL073C	P40323	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YFL065C	P43539	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	SUN4	P53616	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	SUR7	P54003	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	LIP2	Q06005	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	GEP3	Q08622	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	DGA1	Q08650	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	RFM1	Q12192	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	VAR1	P02381	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	CSH1	P38287	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	PET8	P38921	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YJL213W	P40896	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	EOS1	P53938	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	BET2	P20133	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	LST8	P41318	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	DAD4	P69851	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	MRPS5	P33759	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YER181C	P40097	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YCR022C	P25620	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YKR041W	P36134	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	DAD1	Q12248	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YKR032W	P36127	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YBL071C	P38185	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YHR130C	P38834	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YMR141C	P40211	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	NCA3	P46955	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	GON7	P46984	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	PRY1	P47032	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YGR018C	P53211	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	COX10	P21592	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	MSA1	Q08471	629 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	ERG8	P24521	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	MST27	P53176	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	MRPL19	P53875	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	CDC26	P14724	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	YER084W	P40057	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	HPA2	Q06592	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VPS5	YOR069W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	MTC6	P38849	526 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	LTP1	P40347	161 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	ECO1	P43605	281 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	FAB1	P34756	2278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	TIR2	P33890	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YOX1	P34161	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	HST4	P53688	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	SDH7	Q04401	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	GPI18	P38211	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	JID1	Q12350	301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	OXA1	P39952	402 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YFR057W	P43625	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YJL118W	P47022	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	GPI19	Q04082	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	TOA2	P32774	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	MRPL39	P36533	70 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YEL067C	P39978	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YFL015C	P43578	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	DMA2	P53924	522 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	MGR2	Q02889	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	MET32	Q12041	191 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	PCL2	P25693	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	MBB1	P39534	108 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YER076C	P40049	302 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	ATP23	P53722	227 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YNR077C	P53758	84 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	UBC7	Q02159	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	RNH203	Q12338	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YKL070W	P36087	169 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	PIR5	P46999	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	YIP3	P53633	176 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VPS5	YOR069W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53 ms