RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W MIC26P50087 233 aa4.4□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YHP1Q04116 353 aa4.4□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YDR391CQ04170 232 aa4.4□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa4.4□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W SCS22Q6Q595 175 aa4.4□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W ZRT1P32804 376 aa4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W KRE9P39005 276 aa4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W COX16P47081 118 aa4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W UBC13P52490 153 aa4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YNR064CP53750 290 aa4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W GIM5Q04493 163 aa4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W TOM40P23644 387 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YHR173CP38864 112 aa4.38□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W ECO1P43605 281 aa4.38□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YGL118CP53132 145 aa4.38□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W ATP19P81451 68 aa4.38□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa4.38□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W SAL1D6W196 494 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W MBF1O14467 151 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W DDI2P0CH63 225 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W DDI3P0CH64 225 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W HSP12P22943 109 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W ARO2P28777 376 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W PRY2P36110 329 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W SEC72P39742 193 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W HUA1P40325 198 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W SDS23P53172 527 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W MST27P53176 234 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W RAV2Q03956 351 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W API2Q04413 109 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W LIP2Q06005 328 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W RFM1Q12192 310 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W ATO3Q12359 275 aa4.37□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W TIR1P10863 254 aa4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W MRP49P32388 137 aa4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YAR068WP39564 161 aa4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W BDH1P39714 382 aa4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W BRP1P53194 125 aa4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W FIT2Q08906 153 aa4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W WIP1Q2V2P8 89 aa4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YOS1Q3E834 85 aa4.36□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W FPR2P32472 135 aa4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W MRPL39P36533 70 aa4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YER084WP40057 128 aa4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W GON7P46984 123 aa4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W TOM7P53507 60 aa4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YDR114CQ04597 100 aa4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa4.35□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W MRS1P07266 363 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W NOP1P15646 327 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W FZF1P32805 299 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YOX1P34161 385 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W POP7P38291 140 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YCH1P42937 148 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YFR057WP43625 151 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W POP3P53833 195 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W DPP1Q05521 289 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W JID1Q12350 301 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W YLR363W-AQ3E747 85 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W Q0144Q9ZZW2 109 aa4.34□□□□□ -1.71
VHS1YDR247W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W YGP1P38616 354 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W IRC25Q07951 179 aa4.33□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W YPL257WQ08974 193 aa4.33□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W PAI3P01094 68 aa4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W HEM4P06174 275 aa4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W YKL070WP36087 169 aa4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W CIN5P40917 295 aa4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W YGR017WP53210 297 aa4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W CAB4P53332 305 aa4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W MRX11Q03079 207 aa4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W VPS71Q03433 280 aa4.32□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W ANB1P19211 157 aa4.31□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W UTH1P36135 365 aa4.31□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W LSM2P38203 95 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W CSH1P38287 376 aa4.31□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W DOG2P38773 246 aa4.31□□□□□ -1.72
VHS1YDR247W PAU7P39545 55 aa4.31□□□□□ -1.72
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