RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	SRP21	P32342	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	FCY1	Q12178	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	BOR1	P53838	576 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	RIF1	P29539	1916 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	MRPL33	P20084	86 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	YEL068C	P39977	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	NRG1	Q03125	231 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	NAT5	Q08689	176 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	NCA3	P46955	337 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	ROX3	P25046	220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	CNB1	P25296	175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	PAU16	P35994	123 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	YHR173C	P38864	112 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	PAU15	P40585	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	LST8	P41318	303 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	PAU17	Q12370	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	MOT1	P32333	1867 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	YPL073C	P40323	161 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	LAA1	P39526	2014 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	VAR1	P02381	398 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	YIL102C	P40488	101 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	PBA1	Q05778	276 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	TIM18	Q08749	192 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	UGX2	P32772	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	RPB7	P34087	171 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DNF2	YDR093W	YCR007C	P25354	239 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	HAC1	P41546	238 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	PAM17	P36147	197 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	FIP1	P45976	327 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	SGF11	Q03067	99 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	HPA2	Q06592	156 aa		4.09	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YJL028W	P47062	111 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	SPG4	Q04438	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	HOR7	Q05827	59 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	ATG33	Q06485	197 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YCR001W	P25347	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	PRY1	P47032	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	CAX4	P53223	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	VPS71	Q03433	280 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	MRS3	P10566	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YNL195C	P40168	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	CWP2	P43497	92 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YCR041W	P37265	110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YIL152W	P40455	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	PRM5	P40476	318 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YFL015C	P43578	164 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	EMC6	Q12431	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	KRE1	P17260	313 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	FLO5	P38894	1075 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	BDH1	P39714	382 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	SNO1	Q03144	224 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	ENV10	Q99382	181 aa		4.07	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	ECM29	P38737	1868 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	GON7	P46984	123 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YGR050C	P53231	118 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	HAL1	Q01766	294 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	SEC11	P15367	167 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	FMT1	P32785	401 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	DGA1	Q08650	418 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	AYT1	Q12226	474 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	DSK2	P48510	373 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	AVO2	Q04749	426 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	PAU23	Q07987	124 aa		4.06	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	YBL059W	P34224	193 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	PRY2	P36110	329 aa		4.05	□□□□□ -1.76
DNF2	YDR093W	TOM7	P53507	60 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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