RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ALDH9A1	P49189	494 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF134	P52741	427 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WNT3	P56703	355 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	OCA2	Q04671	838 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KRT17	Q04695	432 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ICA1	Q05084	483 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARHGEF7	Q14155	803 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC38	Q502W7	563 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MYCT1	Q8N699	235 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FANCB	Q8NB91	859 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	POC1B	Q8TC44	478 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCT6B	Q92526	530 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LOXL4	Q96JB6	756 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81	3e-6	■□□□□ 8.8
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BDH2	Q9BUT1	245 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	STK33	Q9BYT3	514 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RNF181	Q9P0P0	153 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRIN2B	Q13224	1484 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTPRK	Q15262	1439 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NCOA1	Q15788	1441 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	AHRR	A9YTQ3	701 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DIRC3	C9JPN6	131 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM20B	O75063	409 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SUN1	O94901	812 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	INMT	O95050	263 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RASAL1	O95294	804 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ELANE	P08246	267 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TYRP1	P17643	537 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CPT1A	P50416	773 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SATB1	Q01826	763 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BLMH	Q13867	455 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	INSC	Q1MX18	579 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	C4orf46	Q504U0	113 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	USP49	Q70CQ1	688 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EDA	Q92838	391 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MED15	Q96RN5	788 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CD248	Q9HCU0	757 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	JAG2	Q9Y219	1238 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FMN1	Q68DA7	1419 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KDM6B	O15054	1643 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A087WZ62	844 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CCDC189	A1A4V9	331 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LGALS16	A8MUM7	142 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784		F5H697	171 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TRIM24	O15164	1050 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RGS10	O43665	173 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82

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