RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 ZNF516Q92618 1163 aa21.74■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 SPATA17Q96L03 361 aa21.74■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 SYT15Q9BQS2 421 aa21.74■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 EHD2Q9NZN4 543 aa21.74■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 ZNF202O95125 648 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 CYP2F1P24903 491 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 TNNC1P63316 161 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 CMTM8Q8IZV2 173 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 FSIP1Q8NA03 581 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 FAM84AQ96KN4 292 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.73■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 TSC2P49815 1807 aa21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 NR3C1P04150 777 aa21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 LMO2P25791 158 aa21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 SNX25Q9H3E2 840 aa21.72■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 SHISA7A6NL88 538 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 PHACTR2O75167 634 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 PFKLP17858 780 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 AVPR1AP37288 418 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 MON1AQ86VX9 555 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 TAF4BQ92750 862 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 PIAS3Q9Y6X2 628 aa21.71■■□□□ 1.07
PITX3-201ENST00000370002 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 GFRA3O60609 400 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 FZD5Q13467 585 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 DDR2Q16832 855 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 FAM3CQ92520 227 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 RSPRY1Q96DX4 576 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 TRIM66O15016 1216 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 P4HA1P13674 534 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 CD72P21854 359 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 PPP3CCP48454 512 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 PDE6CP51160 858 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 MYL6P60660 151 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 CYP4F8P98187 520 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 C8orf48Q96LL4 319 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 TDP1Q9NUW8 608 aa21.69■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 NCANO14594 1321 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 LAMTOR5O43504 91 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 ATP2C2O75185 946 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 PDGFRBP09619 1106 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 BIRC3Q13489 604 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 NCOA4Q13772 614 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 ZACNQ401N2 412 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 MYLPFQ96A32 169 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 PCED1BQ96HM7 432 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 RMND1Q9NWS8 449 aa21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 LRRN2O75325 713 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 SP9P0CG40 484 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 GPR15P49685 360 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 ZNF699Q32M78 642 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.67■■□□□ 1.06
PITX3-201ENST00000370002 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms