RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	CAB4	P53332	305 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	NHP10	Q03435	203 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	ZEO1	Q08245	113 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	RTR2	Q12378	196 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	TIR1	P10863	254 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YCR101C	P25607	182 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	UGX2	P32772	223 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	RCN1	P36054	211 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	GPI18	P38211	433 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	SER2	P42941	309 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	GPI2	P46961	280 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	PGU1	P47180	361 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	DML1	Q03652	475 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	ATG39	Q06159	398 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.18	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	ATP5	P09457	212 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	GPA2	P10823	449 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	SRP21	P32342	167 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	VMA11	P32842	164 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	CSH1	P38287	376 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	AIM11	P87275	137 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YDR391C	Q04170	232 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YMR253C	Q04835	414 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	ECM19	Q06011	112 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YOL014W	Q08110	124 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	FLO9	P39712	1322 aa		3.17	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	HIS3	P06633	220 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	SNC2	P33328	115 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	ECM34	P38728	170 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	RRT13	P40042	185 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YER134C	P40081	178 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	FIP1	P45976	327 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	YGL193C	P53097	103 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	VPS71	Q03433	280 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	MIX14	Q04341	121 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	MCP1	Q12106	302 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	SPC3	Q12133	184 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PIR3	YKL163W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	PTC1	P35182	281 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YER181C	P40097	107 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	DSK2	P48510	373 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YGR219W	P53307	113 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	BOL1	Q3E793	110 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	REP2	P03872	296 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	AIF1	P52923	378 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YNL033W	P53964	284 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YNL019C	P53975	284 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	TMA23	Q03525	211 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	AIM36	Q03798	255 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	PSF1	Q12488	208 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	PCL1	P24867	279 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
PIR3	YKL163W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YFL019C	P43576	117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YLR118C	Q12354	227 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	ATP15	P21306	62 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YBR220C	P38318	560 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	PAC10	P48363	199 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	APJ1	P53940	528 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	VPS28	Q02767	242 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	TIM9	O74700	87 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	SGA1	P08019	549 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	RPB9	P27999	122 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	YHR125W	P38831	101 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	MET31	Q03081	177 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PIR3	YKL163W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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