RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	SFT2	P38166	215 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	CYB5	P40312	120 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	HST4	P53688	370 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	YNR071C	P53757	342 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	APS2	Q00381	147 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	AYT1	Q12226	474 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	DCN1	Q12395	269 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YCK1	YHR135C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	PAU3	P25610	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SRP21	P32342	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	DAD2	P36162	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	RRT1	P38192	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YHR173C	P38864	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	PHO85	P17157	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SSS1	P35179	80 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	CPD1	P53314	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	OCA2	P53949	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SEN15	Q04675	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	TMA17	Q12513	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	PAM17	P36147	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	MRPL28	P36527	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SDH7	Q04401	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	CUP2	P15315	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SUR2	P38992	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	GLE2	P40066	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YGR149W	P48236	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YOR105W	Q08504	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	IMP2	P46972	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	CYT2	Q00873	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	MRX11	Q03079	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	FZF1	P32805	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	TIR2	P33890	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	ICS2	P38284	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	ABM1	P47146	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YML122C	Q03207	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	MRS1	P07266	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	QRI5	P32344	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	IRC22	P40006	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YMR141C	P40211	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YIL077C	P40508	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	BNA1	P47096	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	ATP19	P81451	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YKL075C	P36083	450 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	MIX23	P38162	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	TIM18	Q08749	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YCK1	YHR135C	HTB2	P02294	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	CYC3	P06182	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	DDI2	P0CH63	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	DDI3	P0CH64	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	MBB1	P39534	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YDL183C	P48569	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	COX18	P53239	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	ATX2	Q12067	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	TIR1	P10863	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	AIM24	P47127	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YGR025W	P53216	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YGR219W	P53307	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	COX2	P00410	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YPT10	P38146	199 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	CGR1	P53188	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	DAD4	P69851	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	GIM5	Q04493	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	YFR045W	P43617	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	OST3	P48439	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	SDS23	P53172	527 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	INO2	P26798	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	RPB11	P38902	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YCK1	YHR135C	POR2	P40478	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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