RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HDAC5-211ENST00000592385 POLIQ9UNA4 740 aa16.06■□□□□ 0.16
HDAC5-211ENST00000592385 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.06■□□□□ 0.16
HDAC5-211ENST00000592385 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.06■□□□□ 0.16
HDAC5-211ENST00000592385 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.05■□□□□ 0.16
HDAC5-211ENST00000592385 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HDAC5-211ENST00000592385 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HDAC5-211ENST00000592385 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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