RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 CLDN23Q96B33 292 aa28.64■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 SPATA32Q96LK8 384 aa28.64■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 MKNK1Q9BUB5 465 aa28.64■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 IL21Q9HBE4 155 aa28.64■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 SLC39A2Q9NP94 309 aa28.64■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 SERTAD1Q9UHV2 236 aa28.64■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa28.64■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 PRR23AA6NEV1 266 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 DPYSL4O14531 572 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CHADO15335 359 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 RPS9P46781 194 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CYP24A1Q07973 514 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 PSMD2Q13200 908 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 LIMS2Q7Z4I7 341 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 PAGE5Q96GU1 130 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 CGRRF1Q99675 332 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 TMLHEQ9NVH6 421 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 PATJQ8NI35 1801 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 DENND4CQ5VZ89 1909 aa28.63■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 COL4A3Q01955 1670 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 SOBPA7XYQ1 873 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CLIC2O15247 247 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CSH1P0DML2 217 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CSH2P0DML3 217 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 TNNI1P19237 187 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 SOWAHAQ2M3V2 549 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CFAP221Q4G0U5 840 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 STXBP5Q5T5C0 1151 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 RDH13Q8NBN7 331 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 GIPC2Q8TF65 315 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 PKMYT1Q99640 499 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 PI4K2AQ9BTU6 479 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 EXOC1Q9NV70 894 aa28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 LRRN2O75325 713 aa28.61■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 CD72P21854 359 aa28.61■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 TARSP26639 723 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 OSTM1Q86WC4 334 aa28.61■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa28.61■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 DMDP11532 3685 aa28.61■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 FANCMQ8IYD8 2048 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 KLRC4O43908 158 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 FAM163BP0C2L3 166 aa28.6■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 SCARA3Q6AZY7 606 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 C4orf50Q6ZRC1 276 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 TMEM174Q8WUU8 243 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CCDC127Q96BQ5 260 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 RSPRY1Q96DX4 576 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 IER2Q9BTL4 223 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 GTF3C4Q9UKN8 822 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 FBXO4Q9UKT5 387 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CDH9Q9ULB4 789 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 ZDHHC9Q9Y397 364 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 PIAS3Q9Y6X2 628 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 NCANO14594 1321 aa28.6■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 A0A1B0GVL5 298 aa28.59■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 EXOC3O60645 756 aa28.59■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 SP9P0CG40 484 aa28.59■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 ZNF528Q3MIS6 628 aa28.59■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 ASCL5Q7RTU5 278 aa28.59■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa28.58■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 STAU1O95793 577 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
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ODC1-204ENST00000446285 MAGEA11P43364 429 aa28.58■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 AP3M2P53677 418 aa28.58■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 NLRP12P59046 1061 aa28.58■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CYP4F8P98187 520 aa28.58■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa28.58■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 FAM3CQ92520 227 aa28.58■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 CEP295NLQ96MC4 621 aa28.58■■■□□ 2.17
ODC1-204ENST00000446285 SYT15Q9BQS2 421 aa28.58■■■□□ 2.17
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