RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q INO80P53115 1489 aa-0.73□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q HYP2P23301 157 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPT14P32363 452 aa-0.73□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL073CP39974 107 aa-0.73□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q MMS2P53152 137 aa-0.73□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q NQM1P53228 333 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q FYV4P38783 130 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL200CP40165 246 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARO80Q04052 950 aa-0.74□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR127WQ06494 345 aa-0.74□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR214CQ12282 236 aa-0.74□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPD1Q12404 318 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q IGO2Q9P305 131 aa-0.74□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q ECM31P38122 312 aa-0.75□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJL009WP47078 108 aa-0.75□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTC4P53850 401 aa-0.75□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q COA6Q3E846 104 aa-0.75□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNF2P22082 1703 aa-0.75□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRC21Q04772 201 aa-0.76□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q HTB1P02293 131 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q HTB2P02294 131 aa-0.77□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL014CP39999 101 aa-0.77□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD6P06104 172 aa-0.78□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSS2P40990 351 aa-0.78□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q HOP2P53187 214 aa-0.78□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIM13P53299 105 aa-0.78□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL024WQ08172 172 aa-0.78□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q HUG1Q6Q5K6 68 aa-0.78□□□□□ -2.53
tW(UCA)QtW(UCA)Q INO4P13902 151 aa-0.79□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMP32P43557 207 aa-0.79□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM34Q03673 198 aa-0.79□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q MATALPHA2P0CY08 210 aa-0.8□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q HMLALPHA2P0CY09 210 aa-0.8□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q CAF4P36130 643 aa-0.8□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q CMC4Q3E7A9 73 aa-0.8□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL33AP05744 107 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q CSH1P38287 376 aa-0.81□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q RNH1Q04740 348 aa-0.81□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q LAA1P39526 2014 aa-0.82□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q GLR1P41921 483 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG10Q07879 167 aa-0.82□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q UIP4Q08926 304 aa-0.82□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q AHC2P25649 128 aa-0.83□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q NUF2P33895 451 aa-0.83□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q CPR5P35176 225 aa-0.83□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TTI2P47168 421 aa-0.83□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q LIP1Q03579 150 aa-0.83□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q SHH4Q06236 168 aa-0.83□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCL012CQ8J0M4 134 aa-0.83□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q HSP150P32478 413 aa-0.84□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q SYM1Q06563 197 aa-0.84□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDL241WQ07738 123 aa-0.84□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM3Q07527 1436 aa-0.84□□□□□ -2.54
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKL102CP34249 101 aa-0.85□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q XPT1P47165 209 aa-0.85□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q PGA2P53903 129 aa-0.85□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q URA2P07259 2214 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAH1P25638 111 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL028WP39989 153 aa-0.86□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q HSL1P34244 1518 aa-0.86□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD9P14737 1309 aa-0.87□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q DDR48P18899 430 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRX3P25372 127 aa-0.87□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPT31P38555 223 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q IPI1P38803 334 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q DIE2P50076 525 aa-0.87□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q BRX1Q08235 291 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC39P25655 2108 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q QCR7P00128 127 aa-0.88□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q IPT1P38954 527 aa-0.88□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q HPT1Q04178 221 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q NMA1Q06178 401 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q GSC2P40989 1895 aa-0.88□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q BNI1P41832 1953 aa-0.88□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRP102P36057 244 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR114WQ06107 315 aa-0.89□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q FIT3Q08907 204 aa-0.89□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q KTI11Q3E840 82 aa-0.89□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADE6P38972 1358 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q CBF1P17106 351 aa-0.9□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRL3P36167 246 aa-0.9□□□□□ -2.55
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX34P25584 144 aa-0.91□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q EMC4P53073 190 aa-0.91□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q EST3Q03096 181 aa-0.91□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPI11Q06636 219 aa-0.92□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q MHF1Q3E835 90 aa-0.92□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAS2P19097 1887 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL014C-AP0C5N1 53 aa-0.93□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q POR2P40478 281 aa-0.93□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARG80P07249 177 aa-0.94□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL041W-AP0C5N3 154 aa-0.94□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNR064CP53750 290 aa-0.94□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR102CQ03864 110 aa-0.94□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR122CQ03879 124 aa-0.94□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q MYO1P08964 1928 aa-0.95□□□□□ -2.56
tW(UCA)QtW(UCA)Q NVJ1P38881 321 aa-0.95□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 105.6 ms