RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C YDL211CQ12121 372 aa3□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YDL180WQ12301 547 aa3□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C SMT3Q12306 101 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CPT1P17898 393 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C STE18P18852 110 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CDC43P18898 376 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C MRS4P23500 304 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C SPO13P23624 291 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C RNQ1P25367 405 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C ADK2P26364 225 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C RFA3P26755 122 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C VMA11P32842 164 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C GCS1P35197 352 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YKL044WP36092 106 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YIR016WP40572 265 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CDC1P40986 491 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CUP9P41817 306 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YJL118WP47022 219 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C SBH1P52870 82 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C BRP1P53194 125 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C TPC1P53257 314 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YNR048WP53740 393 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YNL143CP53908 130 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YLR152CP54072 576 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C ABF2Q02486 183 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C OPI10Q08202 246 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YPQ1Q12010 308 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C SWT1Q12104 458 aa2.99□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C ERG4P25340 473 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C VMA3P25515 160 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C DSS4P32601 143 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C TIR2P33890 251 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YKR041WP36134 250 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YPT10P38146 199 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C MST28P39552 234 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C ERG28P40030 148 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YNL195CP40168 261 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YIL059CP40520 121 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C APQ12P40532 138 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C PRY1P47032 299 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C TOS2P50078 622 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YIP1P53039 248 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YIP5P53108 310 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C GEP7P53171 287 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CRH1P53301 507 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C AIM11P87275 137 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C RAV2Q03956 351 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YOL029CQ08187 201 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YFL041W-AQ3E817 63 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C ENV10Q99382 181 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C TAD3Q9URQ3 322 aa2.98□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C ECM12O13529 151 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YLR415CO13578 112 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YLL053CP0CD98 152 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C NPR1P22211 790 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YSR3P23501 404 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C ERV1P27882 189 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C ERG2P32352 222 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C MAC1P35192 417 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YHL026CP38740 315 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C SNF11P38956 169 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C GGC1P38988 300 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C YJL193WP39542 402 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CTK2P46962 323 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CPD1P53314 239 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C COX12Q01519 83 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C MIX17Q03667 156 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C UPS1Q05776 175 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C GEP3Q08622 556 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C RFM1Q12192 310 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C KTI11Q3E840 82 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C SCS22Q6Q595 175 aa2.97□□□□□ -1.93
SPT4YGR063C CDC26P14724 124 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C YCR085WP25650 117 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C QRI5P32344 111 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C YBL059WP34224 193 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C SRX1P36077 127 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C PAM17P36147 197 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C FRM2P37261 193 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C YGP1P38616 354 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C RPP1P38786 293 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C CCS1P40202 249 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C YPL073CP40323 161 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C YGR269WP40326 108 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C DFG10P40526 253 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C YFR045WP43617 309 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C ALG13P53178 202 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C SUN4P53616 420 aa2.96□□□□□ -1.94
SPT4YGR063C POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
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