RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	ING5	Q8WYH8	240 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH9	Q9ULB4	789 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.15	□□□□□ -0.46
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMA7	O14818	248 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	IKBKB	O14920	756 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPK13	O15264	365 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ECI2	O75521	394 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CFH	P08603	1231 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CSH1	P0DML2	217 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CSH2	P0DML3	217 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAM9	Q13443	819 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	HTR4	Q13639	388 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	NFIL3	Q16649	462 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF699	Q32M78	642 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FLCN	Q8NFG4	579 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ITFG1	Q8TB96	612 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TMC2	Q8TDI7	906 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF4B	Q92750	862 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMG2	Q969U7	264 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TNIP3	Q96KP6	325 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	L1RE1	Q9UN81	338 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		12.14	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SCN1A	P35498	2009 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	C5orf42	Q9H799	3197 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ANHX	E9PGG2	379 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	NCAM2	O15394	837 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR29	P0C7W0	189 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PIK3CA	P42336	1068 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE6C	P51160	858 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCN5	P51795	746 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	VAMP7	P51809	220 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP27A1	Q02318	531 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ENPEP	Q07075	957 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PNOC	Q13519	176 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	NCOA4	Q13772	614 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SIX5	Q8N196	739 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SMARCD2	Q92925	531 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	IRF7	Q92985	503 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	BORCS6	Q96GS4	357 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SYT15	Q9BQS2	421 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SIX4	Q9UIU6	781 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PRU2	124 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	BICDL2	A1A5D9	508 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246		A8MXQ7	604 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM66	O15016	1216 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	TACC1	O75410	805 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CEBPB	P17676	345 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GABRR2	P28476	465 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIK1	P39086	918 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN5	P54829	565 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC63	Q05C16	580 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	CETN1	Q12798	172 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		12.12	□□□□□ -0.47

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