RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CXCL9Q07325 125 aa17.36■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOX11P35716 441 aa17.36■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IMPG1Q17R60 797 aa17.33■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEI1Q5TIA1 1274 aa17.33■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LONP2Q86WA8 852 aa17.33■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC30BQ8N4P2 665 aa17.33■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.33■□□□□ 0.37
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL15Q16663 113 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFSD14CQ5VZR4 134 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA17Q96L03 361 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXP2O15409 715 aa17.33■□□□□ 0.36
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIC1Q14526 733 aa17.33■□□□□ 0.36
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