RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477099.1

AC079910.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC079910.1, Length 749 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC079910.1-201ENST00000477099 Q6ZPA2 131 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 SYNE4Q8N205 404 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 AMER2Q8N7J2 671 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 TMEM140Q9NV12 185 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.84□□□□□ -1.47
AC079910.1-201ENST00000477099 TNKSO95271 1327 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 SHTN1A0MZ66 631 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 KLHL33A6NCF5 533 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ALG1L2C9J202 215 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 KCNQ3O43525 872 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 LPXNO60711 386 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 GYS1P13807 737 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 LAG3P18627 525 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ATP5JP18859 108 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 KRT4P19013 534 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 CHRNA5P30532 468 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 DDR1Q08345 913 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 MED25Q71SY5 747 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 HS3ST4Q9Y661 456 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 MRC1P22897 1456 aa5.83□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 SCN7AQ01118 1682 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 SBF1O95248 1867 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 DIRC3C9JPN6 131 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 GPR32O75388 356 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 DPEP1P16444 411 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ATP8B2P98198 1209 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 DPTQ07507 201 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 MTM1Q13496 603 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 DCTN1Q14203 1278 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 VRK3Q8IV63 474 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 RAB24Q969Q5 203 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa5.82□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 BCORQ6W2J9 1755 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 DLEC1Q9Y238 1755 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 NDUFA10O95299 355 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ABHD16AO95870 558 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 RFC4P35249 363 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 WASP42768 502 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 C1QTNF8P60827 252 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ODF1Q14990 250 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 PTPN21Q16825 1174 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ZNF529Q6P280 563 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 MCM10Q7L590 875 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 CHFRQ96EP1 664 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 GPATCH3Q96I76 525 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 TEKT5Q96M29 485 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 TIAM2Q8IVF5 1701 aa5.81□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.8□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 PRSS23O95084 383 aa5.8□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 POMCP01189 267 aa5.8□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
AC079910.1-201ENST00000477099 DDCP20711 480 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.1 ms