RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474312.5

GIGYF2-231, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 2

Gene GIGYF2, Length 4,687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-231	ENST00000474312	DFFA	O00273	331 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DYRK3	O43781	588 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TTC4	O95801	387 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ITGB3	P05106	788 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PFKM	P08237	780 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HMBS	P08397	361 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DNAJB2	P25686	324 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SKP1	P63208	163 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ITGA7	Q13683	1181 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SNCB	Q16143	134 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EMB	Q6PCB8	327 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PID1	Q7Z2X4	250 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DDI1	Q8WTU0	396 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EGFL8	Q99944	293 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	IGFLR1	Q9H665	355 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SPG21	Q9NZD8	308 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PKP3	Q9Y446	797 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CACNA1F	O60840	1977 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	AKAP12	Q02952	1782 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RTN2	O75298	545 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ZNF286B	P0CG31	522 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CSH1	P0DML2	217 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CSH2	P0DML3	217 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23	4e-6	■■■■■ 30.6
GIGYF2-231	ENST00000474312	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TWF1	Q12792	350 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	MMEL1	Q495T6	779 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TMEM139	Q8IV31	216 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PASD1	Q8IV76	773 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TLE6	Q9H808	572 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SRGAP2	O75044	1071 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	VTN	P04004	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NCAM1	P13591	858 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FMO5	P49326	533 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	IL9R	Q01113	521 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CGRRF1	Q99675	332 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TEX12	Q9BXU0	123 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CREBZF	Q9NS37	354 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SRRD	Q9UH36	339 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLIT3	O75094	1523 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CHUK	O15111	745 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TRIM49	P0CI25	452 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	TRIM49C	P0CI26	452 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC8A1	P32418	973 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PRCP	P42785	496 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ERAP2	Q6P179	960 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CEP68	Q76N32	757 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	RFFL	Q8WZ73	363 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	KAZALD1	Q96I82	304 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	CIPC	Q9C0C6	399 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ABCC6	O95255	1503 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PHLPP1	O60346	1717 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ANXA9	O76027	345 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	PGK1	P00558	417 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	POMC	P01189	267 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GIGYF2-231	ENST00000474312	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23

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