RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	NRP1	O14786	923 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT86	O43790	486 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	B4GALT3	O60512	393 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	GALT	P07902	379 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	MME	P08473	750 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ODC1	P11926	461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	STK32A	Q8WU08	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529		O00370	1275 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	PCSK1	P29120	753 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	SHH	Q15465	462 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	CWH43	Q9H720	699 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529		A8MXQ7	604 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	THAP12	O43422	761 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	KIF4A	O95239	1232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	MYBL1	P10243	752 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ACR	P10323	421 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	LMO2	P25791	158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	GPD2	P43304	727 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	GALC	P54803	685 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	NOMO3	P69849	1222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	TADA2A	O75478	443 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	MTA2	O94776	668 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	CLSTN1	O94985	981 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	GJB5	O95377	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP1A2	P05177	515 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	ITGB1	P05556	798 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	CD19	P15391	556 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	FGFR3	P22607	806 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	MMP8	P22894	467 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAF4-208	ENST00000469529	BRCC3	P46736	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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