RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARNTLO00327 626 aa28.21■■■□□ 2.11
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHADO15335 359 aa28.21■■■□□ 2.11
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE11AQ9HCR9 933 aa28.19■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNE1P24864 410 aa28.18■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BFSP1Q12934 665 aa28.18■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSSK4Q6SA08 328 aa28.18■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUMF1Q8NBK3 374 aa28.18■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IER2Q9BTL4 223 aa28.18■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLIS3Q8NEA6 775 aa28.16■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPS3Q969F9 1004 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX58Q96C10 678 aa28.16■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA2013Q8IYS2 634 aa28.15■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFYVE19Q96K21 471 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYM5Q9UJ78 669 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX9Q9Y5X1 595 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF233A6NK53 670 aa28.14■■■□□ 2.1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASIC1P78348 528 aa28.14■■■□□ 2.1
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