RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274721.7

GFRA3-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3-201ENST00000274721 IPPQ9Y573 584 aa22.63■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 O00370 1275 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TOMM70O94826 608 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TAP1Q03518 808 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 PIRO00625 290 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 FSCN2O14926 492 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 GPD2P43304 727 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 PAK2Q13177 524 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CYP1B1Q16678 543 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 WNT8BQ93098 351 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CAPNS2Q96L46 248 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 APOL6Q9BWW8 343 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 NFU1Q9UMS0 254 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.62■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 PSTPIP1O43586 416 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 MICAL2O94851 1124 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CD4P01730 458 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 ASGR1P07306 291 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 RSPH3Q86UC2 560 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 IFT81Q8WYA0 676 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.61■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 M0QZ92 97 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TTI1O43156 1089 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 PHF2O75151 1096 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TAS2R40P59535 323 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 NNTQ13423 1086 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 KCNA10Q16322 511 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SGO2Q562F6 1265 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CPXM1Q96SM3 734 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 KLK14Q9P0G3 267 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 PARP2Q9UGN5 583 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CHRNA1P02708 482 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 ELNP15502 786 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CYP3A5P20815 502 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 ECHS1P30084 290 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CHRNA3P32297 505 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 GABRB2P47870 512 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CUL1Q13616 776 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 C18orf8Q96DM3 657 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 MCEEQ96PE7 176 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 RNF19AQ9NV58 838 aa22.6■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 RARAP10276 462 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 OGDHQ02218 1023 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 GRIN2DO15399 1336 aa22.59■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 MGAT3Q09327 533 aa22.58■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.58■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 SRRDQ9UH36 339 aa22.58■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.58■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 NME7Q9Y5B8 376 aa22.58■■□□□ 1.21
GFRA3-201ENST00000274721 RPS6KA5O75582 802 aa22.58■■□□□ 1.2
GFRA3-201ENST00000274721 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.2
GFRA3-201ENST00000274721 DR1Q01658 176 aa22.58■■□□□ 1.2
GFRA3-201ENST00000274721 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
GFRA3-201ENST00000274721 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
GFRA3-201ENST00000274721 STILQ15468 1287 aa22.58■■□□□ 1.2
GFRA3-201ENST00000274721 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.58■■□□□ 1.2
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