RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-215ENST00000592911 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 KYAT1Q16773 422 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 PLK5Q496M5 336 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 PADI6Q6TGC4 694 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 Q6ZS52 159 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 SYT13Q7L8C5 426 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 GATA6Q92908 595 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 KCNN1Q92952 543 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TNFRSF25Q93038 417 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 ACAP3Q96P50 834 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 EDEM2Q9BV94 578 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TASP1Q9H6P5 420 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.5□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 OBSL1O75147 1896 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 LRPAP1P30533 357 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 MCM4P33991 863 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 HOXD12P35452 270 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 PON2Q15165 354 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 WDR44Q5JSH3 913 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 KBTBD6Q86V97 674 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TTC13Q8NBP0 860 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 GCNAQ96QF7 691 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TIPINQ9BVW5 301 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 NCANO14594 1321 aa9.49□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 PTPRDP23468 1912 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 A0A1W2PRU2 124 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 APBB3O95704 486 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 CAVIN2O95810 425 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 C1QTNF9P0C862 333 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 LMAN2Q12907 356 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 VEPH1Q14D04 833 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 PDGFRLQ15198 375 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 CENPPQ6IPU0 288 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 USP37Q86T82 979 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 BSNDQ8WZ55 320 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 DRC1Q96MC2 740 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 AIFM3Q96NN9 605 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 CDT1Q9H211 546 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.48□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 LNP1A1A4G5 178 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 I3L4J1 428 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TK2O00142 265 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 EXTL3O43909 919 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TOM1L1O75674 476 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 TXKP42681 527 aa9.47□□□□□ -0.89
SMAD4-215ENST00000592911 ARPP19P56211 112 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.4 ms