RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567542.5

PRMT7-223, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, human

TSL 1 (best)

Gene PRMT7, Length 3,542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT7-223	ENST00000567542	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	BPIFB4	P59827	614 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PTK6	Q13882	451 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	RIT2	Q99578	217 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	BAG2	O95816	211 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	MAML1	Q92585	1016 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TJP3	O95049	919 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CCND2	P30279	289 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC1A1	P43005	524 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CPA2	P48052	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	POLE2	P56282	527 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PHB	P35232	272 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TTC8	Q8TAM2	541 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	VCX	Q9H320	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	HAUS5	O94927	633 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PSMC4	P43686	418 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	NPTX2	P47972	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	HSD17B4	P51659	736 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	PSMC5	P62195	406 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542		A0A1W2PPM1	405 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	MT-ND3	P03897	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TAS2R40	P59535	323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	OSTN	P61366	133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	NR1H3	Q13133	447 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SSTR1	P30872	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	IGBP1	P78318	339 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	VGLL4	Q14135	290 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CCNG2	Q16589	344 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	HIF1A	Q16665	826 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	RILP	Q96NA2	401 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CYTH2	Q99418	400 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PRMT7-223	ENST00000567542	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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