RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	YOR342C	Q12182	319 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	TSC3	Q3E790	80 aa		2.7	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	MRPL17	P36528	281 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YFL019C	P43576	117 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YMR320W	Q04897	101 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YDL180W	Q12301	547 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	SCM4	P32564	187 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	TTI2	P47168	421 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	MAK3	Q03503	176 aa		2.69	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YHL026C	P38740	315 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YEA4	P40004	342 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.68	□□□□□ -1.98	not detected
YVC1	YOR087W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	AGE2	P40529	298 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YGR042W	P53227	271 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	PLP1	Q04004	230 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	MSW1	P04803	379 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	MIG1	P27705	504 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YAP3	P38749	330 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YGR201C	P42936	225 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	RIB3	Q99258	208 aa		2.68	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YOR1	P53049	1477 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YGL204C	P53089	101 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YDR274C	P87283	123 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	FYV12	Q08559	129 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		2.67	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	DSK2	P48510	373 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	PEX34	P25584	144 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	YHR180W	P38868	163 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	AIM2	P39721	246 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	SPO73	P40031	143 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	APQ12	P40532	138 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	MNN5	P46982	586 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	AIF1	P52923	378 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	PRM7	Q12459	698 aa		2.66	□□□□□ -1.98
YVC1	YOR087W	MPC3	P53311	146 aa		2.65	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	SDH4	P37298	181 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	NSG1	P38837	291 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YJR015W	P47090	510 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	NEJ1	Q06148	342 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	TRS20	P38334	175 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YJL144W	P47009	104 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YDR476C	Q03362	224 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		2.64	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YPR096C	O13587	100 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	AVT2	P39981	480 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	FCY21	P40039	528 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	PGD1	P40356	397 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	FIP1	P45976	327 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	RFU1	Q08003	200 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	ODC2	Q99297	307 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YJR146W	P47174	117 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		2.63	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	STP22	P25604	385 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YER134C	P40081	178 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	DOC1	P53068	250 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	SLM2	P53955	656 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	HRD1	Q08109	551 aa		2.62	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	UMP1	P38293	148 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YBR285W	P38354	144 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	DLS1	P40366	167 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YGR219W	P53307	113 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	TIR1	P10863	254 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	SNC2	P33328	115 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	YNR077C	P53758	84 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	RAV2	Q03956	351 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	CSN9	Q03981	162 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	GAL83	Q04739	417 aa		2.61	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	CLB6	P32943	380 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	XPT1	P47165	209 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	HHT1	P61830	136 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	VPS71	Q03433	280 aa		2.6	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	SPT14	P32363	452 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	TIM8	P57744	87 aa		2.59	□□□□□ -1.99
YVC1	YOR087W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99

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