RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	AVO2	Q04749	426 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YLR302C	O13544	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PHD1	P36093	366 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ERV14	P53173	138 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	TPC1	P53257	314 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	RAF1	Q06891	181 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MIM1	Q08176	113 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	THI72	Q08579	599 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ATX2	Q12067	313 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	SLO1	Q3E784	85 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PAI3	P01094	68 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	SLY41	P22215	453 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MCH2	P36032	473 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	SPC25	P40014	221 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	WSC2	P53832	503 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	HEM25	Q07534	307 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	DGK1	Q12382	290 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	QCR9	P22289	66 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	NFS1	P25374	497 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	CDC50	P25656	391 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YCK3	P39962	524 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	RCE1	Q03530	315 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	RIM9	Q04734	239 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MED7	Q08278	222 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	SAL1	D6W196	494 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ERV1	P27882	189 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	DER1	P38307	211 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YIP5	P53108	310 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YGR126W	P53274	230 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	INN1	P53901	409 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PIN3	Q06449	215 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MRL1	Q06815	381 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	HUT1	Q12520	339 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YSR3	P23501	404 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YGL118C	P53132	145 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	SDS23	P53172	527 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MST27	P53176	234 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MCP1	Q12106	302 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	RFM1	Q12192	310 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PAU19	P0CE85	124 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PAU21	P0CE86	164 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PAU22	P0CE87	164 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PAU3	P25610	124 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
RRP5	YMR229C	SOH1	P38633	127 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	GET2	P40056	285 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	CFD1	P40558	293 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	UBC7	Q02159	165 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	NCE101	Q02820	53 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ATG39	Q06159	398 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	DAD1	Q12248	94 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	RPB8	P20436	146 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PRY2	P36110	329 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	TIM17	P39515	158 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YFR045W	P43617	309 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	SOR2	Q07786	357 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MCT1	Q12283	360 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YKL097C	P34245	136 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	APS1	P35181	156 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ECM14	P38836	430 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	COX15	P40086	486 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	CYB5	P40312	120 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PRY3	P47033	881 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	HNT2	P49775	206 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	DIA1	P54005	336 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	CTR3	Q06686	241 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	APA2	P22108	325 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	FLO10	P36170	1169 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	SDH4	P37298	181 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YND1	P40009	630 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ABF2	Q02486	183 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	FSH2	Q05015	223 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	ARR3	Q06598	404 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	RLM1	Q12224	676 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	MST28	P39552	234 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	YGL185C	P53100	379 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RRP5	YMR229C	STP3	Q05937	343 aa		2.91	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 85.7 ms