RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W PST2Q12335 198 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W TRM10Q12400 293 aa3.35□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W Q0144Q9ZZW2 109 aa3.35□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YER190C-BP0CX94 160 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YEL077W-AP0CX95 160 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YGR296C-BP0CX96 160 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YPL283W-BP0CX97 160 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YPR204C-AP0CX98 160 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W ASK1P35734 292 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W RPR2P40571 144 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W STB1P42845 420 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YGR015CP53208 328 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W ERV29P53337 310 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W HST4P53688 370 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W DID2P69771 204 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W HSK3P69852 69 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W UBC7Q02159 165 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W OSH6Q02201 448 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YOL160WQ08321 113 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YOR342CQ12182 319 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W ATP14Q12349 124 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W WIP1Q2V2P8 89 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W SLO1Q3E784 85 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W YPR014CQ6B0W2 109 aa3.34□□□□□ -1.87
PIR3YKL163W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MAG1P22134 296 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RNA14P25298 677 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W ERG2P32352 222 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W PTM1P32857 523 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W SLM6P38343 150 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W PRS3P38689 320 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YIL012WP40551 113 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W CAT5P41735 233 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YGL101WP53144 215 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W CRH1P53301 507 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RNH201P53942 307 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RMI1Q02685 241 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W GPI17Q04080 534 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W TRM12Q04235 462 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W FMP42Q04991 504 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YDR278CQ05612 105 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MSA1Q08471 629 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W DGA1Q08650 418 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W AKR2Q12013 749 aa3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MBF1O14467 151 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W DSF1P0CX08 502 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YNR073CP0CX09 502 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MRS3P10566 314 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MRPS28P21771 286 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W CPR4P25334 318 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W HSP30P25619 332 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W OCH1P31755 480 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YKL102CP34249 101 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W TRR2P38816 342 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W AST2P39945 430 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MNN5P46982 586 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W FMP48P53233 369 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W WSC2P53832 503 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W HHT1P61830 136 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W SDH7Q04401 133 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W FRQ1Q06389 190 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa3.32□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W UBR1P19812 1950 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W CDC7P06243 507 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RAD10P06838 210 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YFL068WP0CX99 160 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YLL066W-AP0CY00 160 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YLL067W-AP0CY01 160 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YBR063CP38083 404 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W SHE1P38200 338 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W AVT6P40074 448 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YIL067CP40514 678 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W ATG18P43601 500 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RPE1P46969 238 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YJR015WP47090 510 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YGL262WP53054 175 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YPR202WQ08993 238 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YPS3Q12303 508 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YPL229WQ99395 206 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W HTL1Q9URQ5 78 aa3.31□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W KIN28P06242 306 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W PHO2P07269 559 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W CNB1P25296 175 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YCR025CP25352 136 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RPC19P28000 142 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W ATS1P31386 333 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W SMP1P38128 452 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YEA4P40004 342 aa3.3□□□□□ -1.88
PIR3YKL163W YER137CP40083 148 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.8 ms