RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 NUP58Q9BVL2 599 aa7.19□□□□□ -1.26
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PRPF8-210ENST00000574217 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF8-210ENST00000574217 SIX2Q9NPC8 291 aa7.19□□□□□ -1.26
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PRPF8-210ENST00000574217 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.267e-7■■■■■ 73
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PRPF8-210ENST00000574217 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.18□□□□□ -1.26
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PRPF8-210ENST00000574217 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF8-210ENST00000574217 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF8-210ENST00000574217 DPH6Q7L8W6 267 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF8-210ENST00000574217 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.17□□□□□ -1.26
PRPF8-210ENST00000574217 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRPF8-210ENST00000574217 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.17□□□□□ -1.26
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