RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LEXMQ3ZCV2 418 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CT83Q5H943 113 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC29A4Q7RTT9 530 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADHFE1Q8IWW8 467 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SSH1Q8WYL5 1049 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C5orf34Q96MH7 638 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LDAHQ9H6V9 325 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDGFCQ9NRA1 345 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPTLC3Q9NUV7 552 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 E7ENX8 843 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RFPL3O75679 317 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHOP08100 348 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM163BP0C2L3 166 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 JUPP14923 745 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAP2Q03519 686 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF844Q08AG5 666 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MTM1Q13496 603 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BMPR2Q13873 1038 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPY5RQ15761 445 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UGT8Q16880 541 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DACT2Q5SW24 774 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SHC4Q6S5L8 630 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DPP7Q9UHL4 492 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR17Q8IZU2 1322 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KPNA6O60684 536 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB11FIP3O75154 756 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HAUS5O94927 633 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LSSP48449 732 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MC2RQ01718 297 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHDQ02161 417 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP3CAQ08209 521 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADRM1Q16186 407 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF804AQ7Z570 1209 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHSY1Q86X52 802 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FANCBQ8NB91 859 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MKL1Q969V6 931 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYFIP2Q96F07 1278 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAX2Q96IS3 184 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ASB2Q96Q27 587 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GREM2Q9H772 168 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EDARQ9UNE0 448 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDYLQ9Y232 598 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NR2E3Q9Y5X4 410 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS47A8MTI9 375 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR32O75388 356 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ENDOD1O94919 500 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRF1P14222 555 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NDUFB7P17568 137 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDK17Q00537 523 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BROXQ5VW32 411 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD16Q6P6B7 361 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RASSF3Q86WH2 238 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPEARQ8WU66 669 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM255BQ8WV15 326 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NR4A3Q92570 626 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FATE1Q969F0 183 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FKBP10Q96AY3 582 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGEF3Q9NR81 526 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DKK3Q9UBP4 350 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TOR1BO14657 336 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABLIM3O94929 683 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC6A4P31645 630 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPTX2P47972 431 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC6A9P48067 706 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDCD1Q15116 288 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MUM1L1Q5H9M0 696 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXL22Q6P050 247 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRIG1Q96JA1 1093 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0B4J269 797 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H0YIZ8 118 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AGFG2O95081 481 aa2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms