RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 CLIC2O15247 247 aa20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 KINO60870 393 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 POU2F2P09086 479 aa20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ODC1P11926 461 aa20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 CYP2J2P51589 502 aa20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 NTHL1P78549 312 aa20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 M0QZQ0 153 aa20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPEF2O14830 753 aa20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TPGS2Q68CL5 300 aa20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ELMOD1Q8N336 334 aa20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.75■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 LAMP2P13473 410 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATF2P15336 505 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBE2HP62256 183 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 NXPE3Q969Y0 559 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDH7Q9ULB5 785 aa20.74■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF233A6NK53 670 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TBC1D4O60343 1298 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABLIM3O94929 683 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF20AO95235 890 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMC2O95347 1197 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 RFX1P22670 979 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADCY1Q08828 1119 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM84AQ96KN4 292 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRRX2Q99811 253 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 RMND1Q9NWS8 449 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 DPP3Q9NY33 737 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.73■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR6C75A6NL08 312 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TYMPP19971 482 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PAX3P23760 479 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TAF6P49848 677 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 LILRA4P59901 499 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 MTSS1LQ765P7 747 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ING5Q8WYH8 240 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 FGF13Q92913 245 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 SMARCE1Q969G3 411 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 SENP8Q96LD8 212 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF560Q96MR9 790 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIOO75962 3097 aa20.72■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANO9A1A5B4 782 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIRO00625 290 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDXKO00764 312 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 OAZ2O95190 189 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 RHOP08100 348 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFHP08603 1231 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 HTR4Q13639 388 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 METTL23Q86XA0 190 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 RDH13Q8NBN7 331 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 FLCNQ8NFG4 579 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA20Q8TB22 786 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ITFG1Q8TB96 612 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 GSDMAQ96QA5 445 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 CORO1BQ9BR76 489 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTPRJQ12913 1337 aa20.71■□□□□ 0.91
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 EXOC3O60645 756 aa20.7■□□□□ 0.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
USP46-AS1-201ENST00000503051 SEC24AO95486 1093 aa20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms