RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 AHI1Q8N157 1196 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 NANOGP1Q8N7R0 232 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSPEARQ8WU66 669 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 RFKQ969G6 155 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 REPS1Q96D71 796 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADI1Q9BV57 179 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 TLR10Q9BXR5 811 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM171A2A8MVW0 826 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRRT4C9JH25 899 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMIM22K7EJ46 135 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNAJB5O75953 348 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SUN1O94901 812 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FGBP02675 491 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM90A13PP0C7W8 464 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM90A24PP0C7X0 464 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPTX2P47972 431 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 THBS3P49746 956 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 BMPR2Q13873 1038 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDCD1Q15116 288 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT78Q8N1N4 520 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FANCBQ8NB91 859 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ACRBPQ8NEB7 543 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FKBP10Q96AY3 582 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 LYZL4Q96KX0 146 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MANSC1Q9H8J5 431 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 IFT122Q9HBG6 1241 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SERTAD4Q9NUC0 356 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 A0A0B4J269 797 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 E5RJQ4 531 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 AGFG2O95081 481 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 RHOP08100 348 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM191BP0C7N4 346 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPP3CAQ08209 521 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MGAT2Q10469 447 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TUBB3Q13509 450 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SEMA3AQ14563 771 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MUM1Q2TAK8 710 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CNNM4Q6P4Q7 775 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANKRD16Q6P6B7 361 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q6ZTC4 211 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCHCR1Q8TD31 782 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATRIPQ8WXE1 791 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADAMTS3O15072 1205 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIAP1O43715 76 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 BCAR3O75815 825 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM163BP0C2L3 166 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 DDCP20711 480 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MC2RQ01718 297 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MALLQ13021 153 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERV3-1Q14264 604 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TCEA2Q15560 299 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NFE2L2Q16236 605 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q4G0T1 1027 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 USP43Q70EL4 1123 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NRACQ8N912 160 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SSH1Q8WYL5 1049 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TPSD1Q9BZJ3 242 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 DMRT3Q9NQL9 472 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARHGEF3Q9NR81 526 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRSS44E7EML9 344 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NEMP1O14524 444 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ULK1O75385 1050 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP5-9P26371 169 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCSK6P29122 969 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC6A9P48067 706 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SESN3P58005 492 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SHC4Q6S5L8 630 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 CFAP52Q8N1V2 620 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SH3TC2Q8TF17 1288 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.2 ms