RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 SLC11A2P49281 568 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PTTG1IPP53801 180 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 HHEXQ03014 270 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 CTBP1Q13363 440 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 RAB32Q13637 225 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 NOMO2Q5JPE7 1267 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 FAM209BQ5JX69 171 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 Q6ZSN1 163 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 USP37Q86T82 979 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 MICU3Q86XE3 530 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PDPRQ8NCN5 879 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 Q8TCH9 128 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PHACTR3Q96KR7 559 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 TLR10Q9BXR5 811 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SIK2Q9H0K1 926 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 CERS4Q9HA82 394 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PPC4 97 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 M0QYG6 137 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 LEFTY2O00292 366 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 CYP27B1O15528 508 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 ITGB3P05106 788 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 CKBP12277 381 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 ACO1P21399 889 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 FDXRP22570 491 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 KLRC1P26715 233 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 UCP3P55916 312 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 MXRA7P84157 204 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 NHLH2Q02577 135 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 STK3Q13188 491 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PMS2P11Q13670 270 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 KRT72Q14CN4 511 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 Q6ZRM9 215 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SKAP1Q86WV1 359 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 OR56A3Q8NH54 315 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA1191Q96A73 305 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 FAM89AQ96GI7 184 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 MNTQ99583 582 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 CNPPD1Q9BV87 410 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 GPR87Q9BY21 358 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 JAG2Q9Y219 1238 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM233B4DJY2 109 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 APOL1O14791 398 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF623O75123 536 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 FGF18O76093 207 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 KIF20AO95235 890 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 MT-ND5P03915 603 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 IL1R1P14778 569 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 ABCB4P21439 1286 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PPM1AP35813 382 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 MAN2A2P49641 1150 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 SCNN1GP51170 649 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 PIGFQ07326 219 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-205ENST00000391970 FZD5Q13467 585 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms