RNA–Protein interactions for RNA: YKL223W

YKL223W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL223W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL223W	YKL223W	YFR020W	P43600	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YJL028W	P47062	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YLR152C	P54072	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	PIR1	Q03178	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	IZH1	Q03419	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	INP1	Q03694	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	HED1	Q03937	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	TRI1	Q05024	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	SRF1	Q12516	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	COA2	Q3E823	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL223W	YKL223W	MDH2	P22133	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	GEX1	P25596	615 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	CWP1	P28319	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	AGA2	P32781	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	EMP70	P32802	667 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	UME6	P39001	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YER134C	P40081	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YIL012W	P40551	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	XPT1	P47165	209 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YGL230C	P53074	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	DIA1	P54005	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	DAL4	Q04895	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SCW10	Q04951	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	UBA3	Q99344	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SPS18	P32572	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	TIM12	P32830	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	TAE1	P38340	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	POP2	P39008	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YIL169C	P40442	995 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YIL067C	P40514	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YDL183C	P48569	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	PDR17	P53844	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YNL165W	P53891	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	DAD3	P69850	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	ENB1	Q08299	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	MSB2	P32334	1306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SEC11	P15367	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YSR3	P23501	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YGL010W	P25338	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	ADK2	P26364	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	PSD1	P39006	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	PRM5	P40476	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SNO3	P43544	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	RPA43	P46669	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YAR1	P46683	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YJR015W	P47090	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	PMT3	P47190	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	MSY1	P48527	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SNO2	P53823	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	ELC1	Q03071	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	ARR3	Q06598	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SSH4	P32343	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SGE1	P33335	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	DAD2	P36162	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	TEM1	P38987	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YPS6	P40583	537 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	HAC1	P41546	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	GPI2	P46961	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	HIT1	P46973	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YNL184C	P53876	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SEI1	Q06058	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	MET32	Q12041	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	PIN2	Q12057	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	ISA2	Q12425	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	SPO13	P23624	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL223W	YKL223W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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