RNA–Protein interactions for RNA: YHL027W

RIM101, Transcript of Cys2His2 zinc-finger transcriptional repressor, yeast

Gene RIM101, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM101	YHL027W	HUT1	Q12520	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	SAL1	D6W196	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YLR302C	O13544	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	AFG1	P32317	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	SGE1	P33335	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	PAU16	P35994	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	TAE1	P38340	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	ECM34	P38728	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	CDH1	P53197	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	RNH201	P53942	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	SAM50	P53969	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YML096W	Q04489	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	FCY22	Q12119	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	VPS63	O13549	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	ERS1	P17261	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	MRS4	P23500	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YKL070W	P36087	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	BUD8	P41698	603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	TTI2	P47168	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	STP4	Q07351	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	COX17	Q12287	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	MTC7	P32633	139 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	HMT1	P38074	348 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	PFS1	P38872	237 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YFR020W	P43600	232 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	ERG25	P53045	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	GIS1	Q03833	894 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	SNA4	Q07549	140 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM101	YHL027W	ANB1	P19211	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	ELO2	P25358	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	MLF3	P32047	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	RPB11	P38902	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	XBP1	P40489	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	GLO1	P50107	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	LST7	P53237	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YLR152C	P54072	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	MRX8	Q05473	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	MSB2	P32334	1306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	CDC26	P14724	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	DAL82	P21705	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YCR007C	P25354	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	RTG1	P32607	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	TIM12	P32830	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YPT53	P36019	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YKL071W	P36086	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YBR220C	P38318	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	RPP1	P38786	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YIL067C	P40514	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	INP1	Q03694	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	DFG5	Q05031	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	COQ11	Q05892	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	CNL1	Q06333	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YSR3	P23501	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	FIG1	P38224	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YHL044W	P38727	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	LOA1	Q06508	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	PRR2	Q12310	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	COA2	Q3E823	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	UBA3	Q99344	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	PAI3	P01094	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	SAC7	P17121	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	SCO1	P23833	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	MRP49	P32388	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM101	YHL027W	AGA2	P32781	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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