RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619004.2

AC009542.2-202, humanhuman

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Gene AC009542.2, Length 1,067 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009542.2-202ENST00000619004 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.89■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 ZFYVE9O95405 1425 aa22.89■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.88■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.87■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 NWD1Q149M9 1564 aa22.86■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 BCANQ96GW7 911 aa22.86■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
AC009542.2-202ENST00000619004 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
AC009542.2-202ENST00000619004 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
AC009542.2-202ENST00000619004 TMEM94Q12767 1356 aa22.81■■□□□ 1.24
AC009542.2-202ENST00000619004 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.8■■□□□ 1.24
AC009542.2-202ENST00000619004 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
AC009542.2-202ENST00000619004 KCNA6P17658 529 aa22.78■■□□□ 1.24
AC009542.2-202ENST00000619004 NAIPQ13075 1403 aa22.77■■□□□ 1.24
AC009542.2-202ENST00000619004 CLTCL1P53675 1640 aa22.77■■□□□ 1.24
AC009542.2-202ENST00000619004 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.75■■□□□ 1.23
AC009542.2-202ENST00000619004 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
AC009542.2-202ENST00000619004 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.73■■□□□ 1.23
AC009542.2-202ENST00000619004 DIP2AQ14689 1571 aa22.72■■□□□ 1.23
AC009542.2-202ENST00000619004 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.71■■□□□ 1.23
AC009542.2-202ENST00000619004 TRPM2O94759 1503 aa22.7■■□□□ 1.22
AC009542.2-202ENST00000619004 KIF1BO60333 1816 aa22.69■■□□□ 1.22
AC009542.2-202ENST00000619004 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
AC009542.2-202ENST00000619004 HFM1A2PYH4 1435 aa22.67■■□□□ 1.22
AC009542.2-202ENST00000619004 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
AC009542.2-202ENST00000619004 MSH6P52701 1360 aa22.66■■□□□ 1.22
AC009542.2-202ENST00000619004 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 SOCS7O14512 581 aa22.64■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.63■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 TRIM52Q96A61 297 aa22.63■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 TBX22Q9Y458 520 aa22.63■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.63■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 PTPRUQ92729 1446 aa22.63■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 PHLPP1O60346 1717 aa22.62■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 C14orf37Q86TY3 774 aa22.59■■□□□ 1.21
AC009542.2-202ENST00000619004 PIK3R4Q99570 1358 aa22.56■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 METP08581 1390 aa22.54■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.54■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 PPLO60437 1756 aa22.53■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 FOXD1Q16676 465 aa22.53■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 SLAIN2Q9P270 581 aa22.53■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
AC009542.2-202ENST00000619004 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.51■■□□□ 1.19
AC009542.2-202ENST00000619004 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.49■■□□□ 1.19
AC009542.2-202ENST00000619004 ATF3P18847 181 aa22.45■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.45■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.44■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 IFT172Q9UG01 1749 aa22.43■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.41■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 DCCP43146 1447 aa22.4■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.4■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 MST1RQ04912 1400 aa22.4■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.4■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 SHPRHQ149N8 1683 aa22.39■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 JCADQ9P266 1359 aa22.39■■□□□ 1.18
AC009542.2-202ENST00000619004 LRP6O75581 1613 aa22.39■■□□□ 1.17
AC009542.2-202ENST00000619004 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.39■■□□□ 1.17
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AC009542.2-202ENST00000619004 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.37■■□□□ 1.17
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AC009542.2-202ENST00000619004 PTCH1Q13635 1447 aa22.36■■□□□ 1.17
AC009542.2-202ENST00000619004 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.36■■□□□ 1.17
AC009542.2-202ENST00000619004 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.34■■□□□ 1.17
AC009542.2-202ENST00000619004 RGL3Q3MIN7 710 aa22.34■■□□□ 1.17
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AC009542.2-202ENST00000619004 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.32■■□□□ 1.16
AC009542.2-202ENST00000619004 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.32■■□□□ 1.16
AC009542.2-202ENST00000619004 POTEAQ6S8J7 498 aa22.32■■□□□ 1.16
AC009542.2-202ENST00000619004 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
AC009542.2-202ENST00000619004 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.29■■□□□ 1.16
AC009542.2-202ENST00000619004 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.27■■□□□ 1.16
AC009542.2-202ENST00000619004 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.27■■□□□ 1.16
AC009542.2-202ENST00000619004 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.26■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.25■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PIK3C2GO75747 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 STK26Q9P289 416 aa22.23■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.23■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.23■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 LAMC1P11047 1609 aa22.21■■□□□ 1.15
AC009542.2-202ENST00000619004 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.2■■□□□ 1.14
AC009542.2-202ENST00000619004 ORAI2Q96SN7 254 aa22.19■■□□□ 1.14
AC009542.2-202ENST00000619004 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.19■■□□□ 1.14
AC009542.2-202ENST00000619004 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.18■■□□□ 1.14
AC009542.2-202ENST00000619004 TECPR2O15040 1411 aa22.17■■□□□ 1.14
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