RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614056.4

PDCD2-215, Transcript of programmed cell death 2, human

TSL 2 BASIC

Gene PDCD2, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD2-215	ENST00000614056	ITGAE	P38570	1179 aa		42.24	■■■■■ 4.35
PDCD2-215	ENST00000614056		E9PCH4	1651 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PDCD2-215	ENST00000614056	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
PDCD2-215	ENST00000614056	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PDCD2-215	ENST00000614056	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
PDCD2-215	ENST00000614056	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.2	■■■■■ 4.35
PDCD2-215	ENST00000614056	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
PDCD2-215	ENST00000614056	ZFYVE9	O95405	1425 aa		42.19	■■■■■ 4.34
PDCD2-215	ENST00000614056	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PDCD2-215	ENST00000614056	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
PDCD2-215	ENST00000614056	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
PDCD2-215	ENST00000614056	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.17	■■■■■ 4.34
PDCD2-215	ENST00000614056	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.16	■■■■■ 4.34
PDCD2-215	ENST00000614056	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
PDCD2-215	ENST00000614056	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PDCD2-215	ENST00000614056	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
PDCD2-215	ENST00000614056	NUP155	O75694	1391 aa		42.08	■■■■■ 4.33
PDCD2-215	ENST00000614056	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.07	■■■■■ 4.33
PDCD2-215	ENST00000614056	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
PDCD2-215	ENST00000614056	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
PDCD2-215	ENST00000614056	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.05	■■■■■ 4.32
PDCD2-215	ENST00000614056	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	42	■■■■■ 4.31
PDCD2-215	ENST00000614056	MSH6	P52701	1360 aa		42	■■■■■ 4.31
PDCD2-215	ENST00000614056	TBX22	Q9Y458	520 aa		41.94	■■■■■ 4.3
PDCD2-215	ENST00000614056	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		41.91	■■■■■ 4.3
PDCD2-215	ENST00000614056	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PDCD2-215	ENST00000614056	DIP2A	Q14689	1571 aa		41.88	■■■■■ 4.29
PDCD2-215	ENST00000614056	SLAIN2	Q9P270	581 aa		41.86	■■■■■ 4.29
PDCD2-215	ENST00000614056	C14orf37	Q86TY3	774 aa		41.84	■■■■■ 4.29
PDCD2-215	ENST00000614056	PHLPP1	O60346	1717 aa		41.81	■■■■■ 4.28
PDCD2-215	ENST00000614056	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
PDCD2-215	ENST00000614056	TRPM2	O94759	1503 aa		41.79	■■■■■ 4.28
PDCD2-215	ENST00000614056	PIK3R4	Q99570	1358 aa		41.76	■■■■■ 4.28
PDCD2-215	ENST00000614056	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.76	■■■■■ 4.28
PDCD2-215	ENST00000614056	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		41.75	■■■■■ 4.27
PDCD2-215	ENST00000614056	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	41.74	■■■■■ 4.27
PDCD2-215	ENST00000614056	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	41.74	■■■■■ 4.27
PDCD2-215	ENST00000614056	PTPRU	Q92729	1446 aa		41.71	■■■■■ 4.27
PDCD2-215	ENST00000614056	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		41.71	■■■■■ 4.27
PDCD2-215	ENST00000614056	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		41.7	■■■■■ 4.27
PDCD2-215	ENST00000614056	CLTCL1	P53675	1640 aa		41.68	■■■■■ 4.26
PDCD2-215	ENST00000614056	NAIP	Q13075	1403 aa		41.67	■■■■■ 4.26
PDCD2-215	ENST00000614056	ATF3	P18847	181 aa		41.65	■■■■■ 4.26
PDCD2-215	ENST00000614056	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		41.65	■■■■■ 4.26
PDCD2-215	ENST00000614056	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		41.64	■■■■■ 4.26
PDCD2-215	ENST00000614056	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	41.64	■■■■■ 4.26
PDCD2-215	ENST00000614056	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		41.63	■■■■■ 4.25
PDCD2-215	ENST00000614056	JCAD	Q9P266	1359 aa		41.62	■■■■■ 4.25
PDCD2-215	ENST00000614056	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	41.61	■■■■■ 4.25
PDCD2-215	ENST00000614056	KIF1B	O60333	1816 aa		41.59	■■■■■ 4.25
PDCD2-215	ENST00000614056	POTEA	Q6S8J7	498 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PDCD2-215	ENST00000614056	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		41.56	■■■■■ 4.24
PDCD2-215	ENST00000614056	TRIM52	Q96A61	297 aa		41.56	■■■■■ 4.24
PDCD2-215	ENST00000614056	MET	P08581	1390 aa		41.54	■■■■■ 4.24
PDCD2-215	ENST00000614056	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	41.51	■■■■■ 4.24
PDCD2-215	ENST00000614056	HFM1	A2PYH4	1435 aa		41.47	■■■■■ 4.23
PDCD2-215	ENST00000614056	BRINP3	Q76B58	766 aa		41.45	■■■■■ 4.23
PDCD2-215	ENST00000614056	DCC	P43146	1447 aa		41.44	■■■■■ 4.23
PDCD2-215	ENST00000614056	LRP6	O75581	1613 aa		41.42	■■■■■ 4.22
PDCD2-215	ENST00000614056	SHPRH	Q149N8	1683 aa		41.41	■■■■■ 4.22
PDCD2-215	ENST00000614056	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	41.4	■■■■■ 4.22
PDCD2-215	ENST00000614056	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		41.4	■■■■■ 4.22
PDCD2-215	ENST00000614056	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	41.38	■■■■■ 4.21
PDCD2-215	ENST00000614056	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		41.38	■■■■■ 4.21
PDCD2-215	ENST00000614056	MST1R	Q04912	1400 aa		41.37	■■■■■ 4.21
PDCD2-215	ENST00000614056	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		41.37	■■■■■ 4.21
PDCD2-215	ENST00000614056	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		41.35	■■■■■ 4.21
PDCD2-215	ENST00000614056	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	41.32	■■■■■ 4.21
PDCD2-215	ENST00000614056	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	41.31	■■■■■ 4.2
PDCD2-215	ENST00000614056	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		41.29	■■■■■ 4.2
PDCD2-215	ENST00000614056	PPL	O60437	1756 aa		41.27	■■■■■ 4.2
PDCD2-215	ENST00000614056	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	41.27	■■■■■ 4.2
PDCD2-215	ENST00000614056	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	41.27	■■■■■ 4.2
PDCD2-215	ENST00000614056	FOXD1	Q16676	465 aa		41.27	■■■■■ 4.2
PDCD2-215	ENST00000614056	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	41.27	■■■■■ 4.2
PDCD2-215	ENST00000614056	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		41.23	■■■■■ 4.19
PDCD2-215	ENST00000614056	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	41.22	■■■■■ 4.19
PDCD2-215	ENST00000614056	PTCH1	Q13635	1447 aa		41.2	■■■■■ 4.19
PDCD2-215	ENST00000614056	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		41.2	■■■■■ 4.19
PDCD2-215	ENST00000614056	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		41.19	■■■■■ 4.18
PDCD2-215	ENST00000614056	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
PDCD2-215	ENST00000614056	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	41.14	■■■■■ 4.18
PDCD2-215	ENST00000614056	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		41.14	■■■■■ 4.18
PDCD2-215	ENST00000614056	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		41.1	■■■■■ 4.17
PDCD2-215	ENST00000614056	RGL3	Q3MIN7	710 aa		41.08	■■■■■ 4.17
PDCD2-215	ENST00000614056	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		41.06	■■■■■ 4.16
PDCD2-215	ENST00000614056	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		41.06	■■■■■ 4.16
PDCD2-215	ENST00000614056	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		41.05	■■■■■ 4.16
PDCD2-215	ENST00000614056	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		41.05	■■■■■ 4.16
PDCD2-215	ENST00000614056	AFF2	P51816	1311 aa		41.04	■■■■■ 4.16
PDCD2-215	ENST00000614056	ORAI2	Q96SN7	254 aa		41.04	■■■■■ 4.16
PDCD2-215	ENST00000614056	IFT172	Q9UG01	1749 aa		41.01	■■■■■ 4.16
PDCD2-215	ENST00000614056	RXRB	P28702	533 aa		40.99	■■■■■ 4.15
PDCD2-215	ENST00000614056	LAMC1	P11047	1609 aa		40.99	■■■■■ 4.15
PDCD2-215	ENST00000614056	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		40.99	■■■■■ 4.15
PDCD2-215	ENST00000614056	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.98	■■■■■ 4.15
PDCD2-215	ENST00000614056	STK26	Q9P289	416 aa		40.96	■■■■■ 4.15
PDCD2-215	ENST00000614056	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		40.92	■■■■■ 4.14
PDCD2-215	ENST00000614056	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
PDCD2-215	ENST00000614056	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		40.91	■■■■■ 4.14

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