RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MUC1-222	ENST00000610468	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MUC1-222	ENST00000610468	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MUC1-222	ENST00000610468	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
MUC1-222	ENST00000610468	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
MUC1-222	ENST00000610468	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
MUC1-222	ENST00000610468	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MUC1-222	ENST00000610468	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
MUC1-222	ENST00000610468		E9PCH4	1651 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	TBX22	Q9Y458	520 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	21.37	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	BCAN	Q96GW7	911 aa		21.37	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	MSH6	P52701	1360 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	NUP155	O75694	1391 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		21.34	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		21.34	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		21.34	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	DIP2A	Q14689	1571 aa		21.33	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	21.33	■■□□□ 1.01
MUC1-222	ENST00000610468	PIK3R4	Q99570	1358 aa		21.33	■■□□□ 1
MUC1-222	ENST00000610468	SLAIN2	Q9P270	581 aa		21.31	■■□□□ 1
MUC1-222	ENST00000610468	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
MUC1-222	ENST00000610468	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
MUC1-222	ENST00000610468	ITGAE	P38570	1179 aa		21.28	■■□□□ 1
MUC1-222	ENST00000610468	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	21.26	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	TRPM2	O94759	1503 aa		21.24	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	PTPRU	Q92729	1446 aa		21.22	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		21.22	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	JCAD	Q9P266	1359 aa		21.22	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		21.21	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		21.21	■□□□□ 0.99
MUC1-222	ENST00000610468	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	21.19	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		21.18	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	PHLPP1	O60346	1717 aa		21.18	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		21.18	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	POTEA	Q6S8J7	498 aa		21.18	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	C14orf37	Q86TY3	774 aa		21.18	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		21.18	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	DCC	P43146	1447 aa		21.18	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	NAIP	Q13075	1403 aa		21.18	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	21.16	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	ATF3	P18847	181 aa		21.16	■□□□□ 0.98
MUC1-222	ENST00000610468	MET	P08581	1390 aa		21.13	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		21.13	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	CLTCL1	P53675	1640 aa		21.12	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		21.12	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	21.11	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	BRINP3	Q76B58	766 aa		21.11	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	LRP6	O75581	1613 aa		21.1	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	HFM1	A2PYH4	1435 aa		21.1	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	MST1R	Q04912	1400 aa		21.08	■□□□□ 0.97
MUC1-222	ENST00000610468	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		21.07	■□□□□ 0.96
MUC1-222	ENST00000610468	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		21.06	■□□□□ 0.96
MUC1-222	ENST00000610468	SHPRH	Q149N8	1683 aa		21.05	■□□□□ 0.96
MUC1-222	ENST00000610468	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		21.04	■□□□□ 0.96
MUC1-222	ENST00000610468	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		21.04	■□□□□ 0.96
MUC1-222	ENST00000610468	PTCH1	Q13635	1447 aa		21.02	■□□□□ 0.96
MUC1-222	ENST00000610468	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	21	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		20.99	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		20.98	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	20.98	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	20.98	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM52	Q96A61	297 aa		20.98	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	20.98	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	KIF1B	O60333	1816 aa		20.97	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		20.97	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		20.97	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	20.96	■□□□□ 0.95
MUC1-222	ENST00000610468	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		20.94	■□□□□ 0.94
MUC1-222	ENST00000610468	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	20.94	■□□□□ 0.94
MUC1-222	ENST00000610468	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		20.92	■□□□□ 0.94
MUC1-222	ENST00000610468	LAMC1	P11047	1609 aa		20.91	■□□□□ 0.94
MUC1-222	ENST00000610468	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	20.9	■□□□□ 0.94
MUC1-222	ENST00000610468	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	20.9	■□□□□ 0.94
MUC1-222	ENST00000610468	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	20.9	■□□□□ 0.94
MUC1-222	ENST00000610468	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	20.9	■□□□□ 0.94
MUC1-222	ENST00000610468	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	20.88	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	PPL	O60437	1756 aa		20.88	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		20.87	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	AFF2	P51816	1311 aa		20.87	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		20.87	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	20.86	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	RXRB	P28702	533 aa		20.86	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	FOXD1	Q16676	465 aa		20.86	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	ORAI2	Q96SN7	254 aa		20.84	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	TECPR2	O15040	1411 aa		20.84	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		20.84	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		20.83	■□□□□ 0.93
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		20.83	■□□□□ 0.92
MUC1-222	ENST00000610468	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	20.82	■□□□□ 0.92
MUC1-222	ENST00000610468	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		20.82	■□□□□ 0.92
MUC1-222	ENST00000610468	C8orf37	Q96NL8	207 aa		20.81	■□□□□ 0.92

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