RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607707.1

SNORD11B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11B, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11B-201ENST00000607707 BCAMP50895 628 aa5.04□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 MMRN1Q13201 1228 aa5.04□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.04□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 ANKK1Q8NFD2 765 aa5.04□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 STAC3Q96MF2 364 aa5.04□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 GPCPD1Q9NPB8 672 aa5.04□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 CLCN1P35523 988 aa5.03□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 LRCH3Q96II8 777 aa5.03□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC10A3P09131 477 aa5.02□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 RNF40O75150 1001 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 MS4A1P11836 297 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 SLF2Q8IX21 1173 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.01□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 DDX11L8A8MPP1 907 aa5□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 CD46P15529 392 aa5□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 KDM4CQ9H3R0 1056 aa5□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 NEUROD2Q15784 382 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 WBP1LQ9NX94 342 aa4.99□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 CFHP08603 1231 aa4.98□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 PTPN5P54829 565 aa4.98□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 SULF1Q8IWU6 871 aa4.98□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 RDH13Q8NBN7 331 aa4.98□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC4A3P48751 1232 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 APLP1P51693 650 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 PPP4CP60510 307 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD11B-201ENST00000607707 GCGRP47871 477 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 NECTIN2Q92692 538 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 KMT5BQ4FZB7 885 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 NYAP1Q6ZVC0 841 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 FAM117AQ9C073 453 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 HCSTQ9UBK5 93 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 HOXA2O43364 376 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 KDM4AO75164 1064 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 FUT2Q10981 343 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 HLA-CQ95604 372 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 PRR14Q9BWN1 585 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.92□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.92□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.92□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 ATP6V1AP38606 617 aa4.91□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 GUCA2AQ02747 115 aa4.91□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.91□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 MORN1Q5T089 497 aa4.91□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.91□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 MTRQ99707 1265 aa4.91□□□□□ -1.62
SNORD11B-201ENST00000607707 MOXD2PA6NHM9 499 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 COPS2P61201 443 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 USP46P62068 366 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 MYSM1Q5VVJ2 828 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 TLL1O43897 1013 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 NDUFV2P19404 249 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 IL27Q8NEV9 243 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 SPTLC1O15269 473 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 CLK2P49760 499 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 ZNF516Q92618 1163 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 IL21Q9HBE4 155 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 PCDHGC3Q9UN70 934 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 ZPR1O75312 459 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 FDX1P10109 184 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 GRIPAP1Q4V328 841 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 RIC3Q7Z5B4 369 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 THAP11Q96EK4 314 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 NR1I2O75469 434 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 GJA5P36382 358 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 TUSC1Q2TAM9 212 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 RSPH6AQ9H0K4 717 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 GOPCQ9HD26 462 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD11B-201ENST00000607707 KCNC4Q03721 635 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.4 ms