RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603448.1

AP002365.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP002365.1, Length 772 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002365.1-201ENST00000603448 NWD1Q149M9 1564 aa44.2■■■■■ 4.67
AP002365.1-201ENST00000603448 ILDR2Q71H61 639 aa44.2■■■■■ 4.67
AP002365.1-201ENST00000603448 SLC26A8Q96RN1 970 aa44.2■■■■■ 4.67
AP002365.1-201ENST00000603448 RIMS2Q9UQ26 1411 aa44.2■■■■■ 4.67
AP002365.1-201ENST00000603448 KCNA6P17658 529 aa44.18■■■■■ 4.66
AP002365.1-201ENST00000603448 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa44.16■■■■■ 4.66
AP002365.1-201ENST00000603448 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa44.15■■■■■ 4.66
AP002365.1-201ENST00000603448 HDGFP51858 240 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
AP002365.1-201ENST00000603448 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
AP002365.1-201ENST00000603448 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
AP002365.1-201ENST00000603448 BCANQ96GW7 911 aa44.11■■■■■ 4.65
AP002365.1-201ENST00000603448 CHGAP10645 457 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
AP002365.1-201ENST00000603448 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
AP002365.1-201ENST00000603448 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
AP002365.1-201ENST00000603448 TMEM94Q12767 1356 aa44.08■■■■■ 4.65
AP002365.1-201ENST00000603448 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP44.05■■■■■ 4.64
AP002365.1-201ENST00000603448 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
AP002365.1-201ENST00000603448 NAIPQ13075 1403 aa44.01■■■■■ 4.64
AP002365.1-201ENST00000603448 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
AP002365.1-201ENST00000603448 DIP2AQ14689 1571 aa44■■■■■ 4.63
AP002365.1-201ENST00000603448 TBX22Q9Y458 520 aa43.95■■■■■ 4.63
AP002365.1-201ENST00000603448 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa43.93■■■■■ 4.62
AP002365.1-201ENST00000603448 FAM135BQ49AJ0 1406 aa43.91■■■■■ 4.62
AP002365.1-201ENST00000603448 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
AP002365.1-201ENST00000603448 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
AP002365.1-201ENST00000603448 SOCS7O14512 581 aa43.9■■■■■ 4.62
AP002365.1-201ENST00000603448 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa43.89■■■■■ 4.62
AP002365.1-201ENST00000603448 CLTCL1P53675 1640 aa43.88■■■■■ 4.61
AP002365.1-201ENST00000603448 HFM1A2PYH4 1435 aa43.87■■■■■ 4.61
AP002365.1-201ENST00000603448 TRPM2O94759 1503 aa43.87■■■■■ 4.61
AP002365.1-201ENST00000603448 MSH6P52701 1360 aa43.86■■■■■ 4.61
AP002365.1-201ENST00000603448 KIF1BO60333 1816 aa43.85■■■■■ 4.61
AP002365.1-201ENST00000603448 PIK3R4Q99570 1358 aa43.84■■■■■ 4.61
AP002365.1-201ENST00000603448 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa43.81■■■■■ 4.6
AP002365.1-201ENST00000603448 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa43.79■■■■■ 4.6
AP002365.1-201ENST00000603448 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa43.78■■■■■ 4.6
AP002365.1-201ENST00000603448 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
AP002365.1-201ENST00000603448 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa43.72■■■■■ 4.59
AP002365.1-201ENST00000603448 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
AP002365.1-201ENST00000603448 TRIM52Q96A61 297 aa43.69■■■■■ 4.58
AP002365.1-201ENST00000603448 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
AP002365.1-201ENST00000603448 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
AP002365.1-201ENST00000603448 PTPRUQ92729 1446 aa43.67■■■■■ 4.58
AP002365.1-201ENST00000603448 SLAIN2Q9P270 581 aa43.66■■■■■ 4.58
AP002365.1-201ENST00000603448 PHLPP1O60346 1717 aa43.65■■■■■ 4.58
AP002365.1-201ENST00000603448 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa43.63■■■■■ 4.57
AP002365.1-201ENST00000603448 C14orf37Q86TY3 774 aa43.6■■■■■ 4.57
AP002365.1-201ENST00000603448 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
AP002365.1-201ENST00000603448 C19orf44Q9H6X5 657 aa43.55■■■■■ 4.56
AP002365.1-201ENST00000603448 CADPS2Q86UW7 1296 aa43.53■■■■■ 4.56
AP002365.1-201ENST00000603448 METP08581 1390 aa43.52■■■■■ 4.56
AP002365.1-201ENST00000603448 PPLO60437 1756 aa43.51■■■■■ 4.56
AP002365.1-201ENST00000603448 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
AP002365.1-201ENST00000603448 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
AP002365.1-201ENST00000603448 ATF3P18847 181 aa43.48■■■■■ 4.55
AP002365.1-201ENST00000603448 DCCP43146 1447 aa43.47■■■■■ 4.55
AP002365.1-201ENST00000603448 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
AP002365.1-201ENST00000603448 VGFO15240 615 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
AP002365.1-201ENST00000603448 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa43.4■■■■■ 4.54
AP002365.1-201ENST00000603448 JCADQ9P266 1359 aa43.39■■■■■ 4.54
AP002365.1-201ENST00000603448 NALCNQ8IZF0 1738 aa43.38■■■■■ 4.53
AP002365.1-201ENST00000603448 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
AP002365.1-201ENST00000603448 FOXD1Q16676 465 aa43.35■■■■■ 4.53
AP002365.1-201ENST00000603448 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa43.32■■■■■ 4.53
AP002365.1-201ENST00000603448 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.31■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 SHPRHQ149N8 1683 aa43.3■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 MST1RQ04912 1400 aa43.3■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 IFT172Q9UG01 1749 aa43.29■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.29■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 PTCH1Q13635 1447 aa43.28■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 BRINP3Q76B58 766 aa43.27■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa43.27■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 NHSL1Q5SYE7 1610 aa43.26■■■■■ 4.52
AP002365.1-201ENST00000603448 PRAG1Q86YV5 1406 aa43.24■■■■■ 4.51
AP002365.1-201ENST00000603448 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
AP002365.1-201ENST00000603448 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa43.21■■■■■ 4.51
AP002365.1-201ENST00000603448 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.19■■■■■ 4.5
AP002365.1-201ENST00000603448 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa43.18■■■■■ 4.5
AP002365.1-201ENST00000603448 ROBO2Q9HCK4 1378 aa43.16■■■■■ 4.5
AP002365.1-201ENST00000603448 LRP6O75581 1613 aa43.14■■■■■ 4.5
AP002365.1-201ENST00000603448 POTEAQ6S8J7 498 aa43.11■■■■■ 4.49
AP002365.1-201ENST00000603448 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.11■■■■■ 4.49
AP002365.1-201ENST00000603448 RGL3Q3MIN7 710 aa43.1■■■■■ 4.49
AP002365.1-201ENST00000603448 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa43.1■■■■■ 4.49
AP002365.1-201ENST00000603448 C1orf167Q5SNV9 1468 aa43.06■■■■■ 4.48
AP002365.1-201ENST00000603448 LAMC1P11047 1609 aa43.04■■■■■ 4.48
AP002365.1-201ENST00000603448 KNDC1Q76NI1 1749 aa43.03■■■■■ 4.48
AP002365.1-201ENST00000603448 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.02■■■■■ 4.48
AP002365.1-201ENST00000603448 PIK3C2GO75747 1445 aa42.99■■■■■ 4.47
AP002365.1-201ENST00000603448 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
AP002365.1-201ENST00000603448 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.97■■■■■ 4.47
AP002365.1-201ENST00000603448 TECPR2O15040 1411 aa42.97■■■■■ 4.47
AP002365.1-201ENST00000603448 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
AP002365.1-201ENST00000603448 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
AP002365.1-201ENST00000603448 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
AP002365.1-201ENST00000603448 MYOM2P54296 1465 aa42.87■■■■■ 4.45
AP002365.1-201ENST00000603448 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
AP002365.1-201ENST00000603448 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
AP002365.1-201ENST00000603448 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
AP002365.1-201ENST00000603448 PNPLA6Q8IY17 1366 aa42.87■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms