RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TTLL3-233	ENST00000602338		E9PCH4	1651 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNA6	P17658	529 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		18.55	■□□□□ 0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	PHLPP1	O60346	1717 aa		18.53	■□□□□ 0.56
TTLL3-233	ENST00000602338	MSH6	P52701	1360 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	BCAN	Q96GW7	911 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ROCK1	Q13464	1354 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	DIP2A	Q14689	1571 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	POTEA	Q6S8J7	498 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SLAIN2	Q9P270	581 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	TBX22	Q9Y458	520 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPM2	O94759	1503 aa		18.43	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP155	O75694	1391 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRU	Q92729	1446 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	18.4	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	LRP6	O75581	1613 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	JCAD	Q9P266	1359 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3R4	Q99570	1358 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SHPRH	Q149N8	1683 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGAE	P38570	1179 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CLTCL1	P53675	1640 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	C14orf37	Q86TY3	774 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	DCC	P43146	1447 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	MET	P08581	1390 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF1B	O60333	1816 aa		18.29	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	ATF3	P18847	181 aa		18.29	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	BRINP3	Q76B58	766 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	MST1R	Q04912	1400 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TTLL3-233	ENST00000602338	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	NAIP	Q13075	1403 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TTLL3-233	ENST00000602338	PPL	O60437	1756 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMC1	P11047	1609 aa		18.19	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PTCH1	Q13635	1447 aa		18.18	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM52	Q96A61	297 aa		18.16	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	HFM1	A2PYH4	1435 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		18.15	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		18.14	■□□□□ 0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	AFF2	P51816	1311 aa		18.13	■□□□□ 0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	18.11	■□□□□ 0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT172	Q9UG01	1749 aa		18.09	■□□□□ 0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS12	O14924	1447 aa		18.09	■□□□□ 0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	RXRB	P28702	533 aa		18.09	■□□□□ 0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		18.08	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	C8orf37	Q96NL8	207 aa		18.07	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ORAI2	Q96SN7	254 aa		18.06	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXD1	Q16676	465 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS2	O95450	1211 aa		18.02	■□□□□ 0.48
TTLL3-233	ENST00000602338	PXDN	Q92626	1479 aa		18.01	■□□□□ 0.47

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