RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 NWD1Q149M9 1564 aa35.39■■■■□ 3.26
MBD3-211ENST00000592965 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.38■■■■□ 3.26
MBD3-211ENST00000592965 HSPA1LP34931 641 aa35.38■■■■□ 3.25
MBD3-211ENST00000592965 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.38■■■■□ 3.25
MBD3-211ENST00000592965 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.37■■■■□ 3.25
MBD3-211ENST00000592965 KCNA6P17658 529 aa35.36■■■■□ 3.25
MBD3-211ENST00000592965 NAIPQ13075 1403 aa35.36■■■■□ 3.25
MBD3-211ENST00000592965 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
MBD3-211ENST00000592965 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
MBD3-211ENST00000592965 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
MBD3-211ENST00000592965 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
MBD3-211ENST00000592965 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.3■■■■□ 3.24
MBD3-211ENST00000592965 TMEM94Q12767 1356 aa35.29■■■■□ 3.24
MBD3-211ENST00000592965 BCANQ96GW7 911 aa35.29■■■■□ 3.24
MBD3-211ENST00000592965 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
MBD3-211ENST00000592965 HFM1A2PYH4 1435 aa35.26■■■■□ 3.24
MBD3-211ENST00000592965 DIP2AQ14689 1571 aa35.25■■■■□ 3.23
MBD3-211ENST00000592965 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
MBD3-211ENST00000592965 TBX22Q9Y458 520 aa35.21■■■■□ 3.23
MBD3-211ENST00000592965 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.21■■■■□ 3.23
MBD3-211ENST00000592965 ILDR2Q71H61 639 aa35.2■■■■□ 3.23
MBD3-211ENST00000592965 TRPM2O94759 1503 aa35.2■■■■□ 3.23
MBD3-211ENST00000592965 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
MBD3-211ENST00000592965 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
MBD3-211ENST00000592965 CLTCL1P53675 1640 aa35.17■■■■□ 3.22
MBD3-211ENST00000592965 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
MBD3-211ENST00000592965 PIK3R4Q99570 1358 aa35.13■■■■□ 3.21
MBD3-211ENST00000592965 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.13■■■■□ 3.21
MBD3-211ENST00000592965 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
MBD3-211ENST00000592965 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.09■■■■□ 3.21
MBD3-211ENST00000592965 KIF1BO60333 1816 aa35.09■■■■□ 3.21
MBD3-211ENST00000592965 MSH6P52701 1360 aa35.09■■■■□ 3.21
MBD3-211ENST00000592965 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.09■■■■□ 3.21
MBD3-211ENST00000592965 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.06■■■■□ 3.2
MBD3-211ENST00000592965 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.06■■■■□ 3.2
MBD3-211ENST00000592965 TRIM52Q96A61 297 aa35.05■■■■□ 3.2
MBD3-211ENST00000592965 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.04■■■■□ 3.2
MBD3-211ENST00000592965 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
MBD3-211ENST00000592965 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
MBD3-211ENST00000592965 PTPRUQ92729 1446 aa34.98■■■■□ 3.19
MBD3-211ENST00000592965 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
MBD3-211ENST00000592965 SOCS7O14512 581 aa34.97■■■■□ 3.19
MBD3-211ENST00000592965 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
MBD3-211ENST00000592965 SLAIN2Q9P270 581 aa34.93■■■■□ 3.18
MBD3-211ENST00000592965 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.93■■■■□ 3.18
MBD3-211ENST00000592965 C14orf37Q86TY3 774 aa34.89■■■■□ 3.18
MBD3-211ENST00000592965 METP08581 1390 aa34.87■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.87■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 PHLPP1O60346 1717 aa34.85■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 PPLO60437 1756 aa34.85■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.84■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.82■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 DCCP43146 1447 aa34.82■■■■□ 3.17
MBD3-211ENST00000592965 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
MBD3-211ENST00000592965 ATF3P18847 181 aa34.8■■■■□ 3.16
MBD3-211ENST00000592965 FOXD1Q16676 465 aa34.77■■■■□ 3.16
MBD3-211ENST00000592965 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
MBD3-211ENST00000592965 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.76■■■■□ 3.16
MBD3-211ENST00000592965 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.75■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.72■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.72■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.71■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 PTCH1Q13635 1447 aa34.71■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.71■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 JCADQ9P266 1359 aa34.7■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.7■■■■□ 3.15
MBD3-211ENST00000592965 IFT172Q9UG01 1749 aa34.69■■■■□ 3.14
MBD3-211ENST00000592965 MST1RQ04912 1400 aa34.66■■■■□ 3.14
MBD3-211ENST00000592965 BRINP3Q76B58 766 aa34.63■■■■□ 3.13
MBD3-211ENST00000592965 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
MBD3-211ENST00000592965 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.63■■■■□ 3.13
MBD3-211ENST00000592965 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.61■■■■□ 3.13
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.6■■■■□ 3.13
MBD3-211ENST00000592965 SHPRHQ149N8 1683 aa34.6■■■■□ 3.13
MBD3-211ENST00000592965 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.59■■■■□ 3.13
MBD3-211ENST00000592965 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.59■■■■□ 3.13
MBD3-211ENST00000592965 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.55■■■■□ 3.12
MBD3-211ENST00000592965 RGL3Q3MIN7 710 aa34.55■■■■□ 3.12
MBD3-211ENST00000592965 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.53■■■■□ 3.12
MBD3-211ENST00000592965 PIK3C2GO75747 1445 aa34.51■■■■□ 3.12
MBD3-211ENST00000592965 LRP6O75581 1613 aa34.48■■■■□ 3.11
MBD3-211ENST00000592965 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.48■■■■□ 3.11
MBD3-211ENST00000592965 TECPR2O15040 1411 aa34.47■■■■□ 3.11
MBD3-211ENST00000592965 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.47■■■■□ 3.11
MBD3-211ENST00000592965 LAMC1P11047 1609 aa34.45■■■■□ 3.11
MBD3-211ENST00000592965 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.44■■■■□ 3.1
MBD3-211ENST00000592965 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
MBD3-211ENST00000592965 MYOM2P54296 1465 aa34.42■■■■□ 3.1
MBD3-211ENST00000592965 POTEAQ6S8J7 498 aa34.42■■■■□ 3.1
MBD3-211ENST00000592965 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.41■■■■□ 3.1
MBD3-211ENST00000592965 ABCC11Q96J66 1382 aa34.38■■■■□ 3.09
MBD3-211ENST00000592965 HRCP23327 699 aa34.36■■■■□ 3.09
MBD3-211ENST00000592965 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
MBD3-211ENST00000592965 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
MBD3-211ENST00000592965 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
MBD3-211ENST00000592965 STK26Q9P289 416 aa34.34■■■■□ 3.09
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