RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 NWD1Q149M9 1564 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 MSH6P52701 1360 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.29■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 POTEAQ6S8J7 498 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 ZFYVE9O95405 1425 aa20.27■□□□□ 0.83
NEDD4L-232ENST00000591579 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.27■□□□□ 0.83
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NEDD4L-232ENST00000591579 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.22■□□□□ 0.83
NEDD4L-232ENST00000591579 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
NEDD4L-232ENST00000591579 JCADQ9P266 1359 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD4L-232ENST00000591579 PHLPP1O60346 1717 aa20.2■□□□□ 0.82
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.2■□□□□ 0.82
NEDD4L-232ENST00000591579 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
NEDD4L-232ENST00000591579 UNC13BO14795 1591 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
NEDD4L-232ENST00000591579 TBX22Q9Y458 520 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD4L-232ENST00000591579 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD4L-232ENST00000591579 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.15■□□□□ 0.82
NEDD4L-232ENST00000591579 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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NEDD4L-232ENST00000591579 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.13■□□□□ 0.81
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NEDD4L-232ENST00000591579 DIP2AQ14689 1571 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 ATF3P18847 181 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 LRP6O75581 1613 aa20.12■□□□□ 0.81
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NEDD4L-232ENST00000591579 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 ROCK1Q13464 1354 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 PIK3R4Q99570 1358 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 TRPM2O94759 1503 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD4L-232ENST00000591579 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.08■□□□□ 0.8
NEDD4L-232ENST00000591579 NUP155O75694 1391 aa20.08■□□□□ 0.8
NEDD4L-232ENST00000591579 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD4L-232ENST00000591579 ITGAEP38570 1179 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD4L-232ENST00000591579 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD4L-232ENST00000591579 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD4L-232ENST00000591579 PTPRUQ92729 1446 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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NEDD4L-232ENST00000591579 TRIM52Q96A61 297 aa20.03■□□□□ 0.8
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NEDD4L-232ENST00000591579 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NEDD4L-232ENST00000591579 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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NEDD4L-232ENST00000591579 DCCP43146 1447 aa20■□□□□ 0.79
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NEDD4L-232ENST00000591579 MST1RQ04912 1400 aa19.96■□□□□ 0.79
NEDD4L-232ENST00000591579 METP08581 1390 aa19.95■□□□□ 0.79
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NEDD4L-232ENST00000591579 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.78
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NEDD4L-232ENST00000591579 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa19.93■□□□□ 0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.92■□□□□ 0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.92■□□□□ 0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
NEDD4L-232ENST00000591579 NHSL1Q5SYE7 1610 aa19.88■□□□□ 0.77
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NEDD4L-232ENST00000591579 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
NEDD4L-232ENST00000591579 C8orf37Q96NL8 207 aa19.88■□□□□ 0.77
NEDD4L-232ENST00000591579 CLTCL1P53675 1640 aa19.87■□□□□ 0.77
NEDD4L-232ENST00000591579 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
NEDD4L-232ENST00000591579 PNPLA6Q8IY17 1366 aa19.87■□□□□ 0.77
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NEDD4L-232ENST00000591579 RGS12O14924 1447 aa19.84■□□□□ 0.77
NEDD4L-232ENST00000591579 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.82■□□□□ 0.76
NEDD4L-232ENST00000591579 ADAMTS2O95450 1211 aa19.82■□□□□ 0.76
NEDD4L-232ENST00000591579 PTCH1Q13635 1447 aa19.81■□□□□ 0.76
NEDD4L-232ENST00000591579 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
NEDD4L-232ENST00000591579 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.8■□□□□ 0.76
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NEDD4L-232ENST00000591579 NGLY1Q96IV0 654 aa19.79■□□□□ 0.76
NEDD4L-232ENST00000591579 NAIPQ13075 1403 aa19.77■□□□□ 0.76
NEDD4L-232ENST00000591579 ORAI2Q96SN7 254 aa19.77■□□□□ 0.76
NEDD4L-232ENST00000591579 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
NEDD4L-232ENST00000591579 KIF1BO60333 1816 aa19.74■□□□□ 0.75
NEDD4L-232ENST00000591579 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
NEDD4L-232ENST00000591579 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
NEDD4L-232ENST00000591579 USP21Q9UK80 565 aa19.72■□□□□ 0.75
NEDD4L-232ENST00000591579 HFM1A2PYH4 1435 aa19.71■□□□□ 0.75
NEDD4L-232ENST00000591579 LAMC1P11047 1609 aa19.71■□□□□ 0.75
NEDD4L-232ENST00000591579 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.7■□□□□ 0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.7■□□□□ 0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ATAD2Q6PL18 1390 aa19.7■□□□□ 0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ESCO1Q5FWF5 840 aa19.67■□□□□ 0.74
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