RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-210ENST00000590211 TSKSQ9UJT2 592 aa7.04□□□□□ -1.28
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEB2H3BUK9 544 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.03□□□□□ -1.28
CAPNS1-210ENST00000590211 SPTLC1O15269 473 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 LHX6Q9UPM6 363 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 DOK7Q18PE1 504 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 RETREG2Q8NC44 543 aa6.99□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 SOCS7O14512 581 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 LILRB3O75022 631 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 GJA5P36382 358 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 QPCTQ16769 361 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEHQ6S545 545 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.98□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFV2P19404 249 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 TATDN2Q93075 761 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJB2P25686 324 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 IRF5Q13568 498 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.96□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 SULF1Q8IWU6 871 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 RIMBP2O15034 1052 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PNMA3Q9UL41 463 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR37L1O60883 481 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPREP23469 700 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PROX2Q3B8N5 592 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS22Q8NE09 1264 aa6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF26B4DH59 902 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 SMAPO00193 183 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.92□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 POM121CA8CG34 1229 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.91□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXA2O43364 376 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC10A3P09131 477 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 USP17L8P0C7I0 530 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 ABL2P42684 1182 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 GCGRP47871 477 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 PACS2Q86VP3 889 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 WWC1Q8IX03 1113 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CAPNS1-210ENST00000590211 KDM4AO75164 1064 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 GLMNQ92990 594 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 MTMR7Q9Y216 660 aa6.89□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 AP1G2O75843 785 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-CQ95604 372 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.88□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 USP46P62068 366 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 GUCA2AQ02747 115 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE4CQ08493 712 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.87□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 FDX1P10109 184 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 RDH13Q8NBN7 331 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.86□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNK17Q96T54 332 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-210ENST00000590211 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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