RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HFM1A2PYH4 1435 aa36.46■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.46■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCNA6P17658 529 aa36.45■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BCANQ96GW7 911 aa36.42■■■■□ 3.42
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.38■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HSPA1LP34931 641 aa36.36■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NWD1Q149M9 1564 aa36.36■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.35■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM94Q12767 1356 aa36.33■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TBX22Q9Y458 520 aa36.32■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRIM52Q96A61 297 aa36.3■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRPM2O94759 1503 aa36.28■■■■□ 3.4
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DIP2AQ14689 1571 aa36.24■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CLTCL1P53675 1640 aa36.23■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PIK3R4Q99570 1358 aa36.2■■■■□ 3.39
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.14■■■■□ 3.38
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.12■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MSH6P52701 1360 aa36.12■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.11■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.11■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.1■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KIF1BO60333 1816 aa36.09■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ILDR2Q71H61 639 aa36.08■■■■□ 3.37
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PTPRUQ92729 1446 aa36.06■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.05■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FOXD1Q16676 465 aa36■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLAIN2Q9P270 581 aa36■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.99■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.98■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 METP08581 1390 aa35.98■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C14orf37Q86TY3 774 aa35.96■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.96■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.95■■■■□ 3.35
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.91■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.9■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATF3P18847 181 aa35.87■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PPLO60437 1756 aa35.85■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DCCP43146 1447 aa35.83■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.83■■■■□ 3.33
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.82■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SOCS7O14512 581 aa35.8■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RGL3Q3MIN7 710 aa35.76■■■■□ 3.32
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PHLPP1O60346 1717 aa35.75■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PTCH1Q13635 1447 aa35.74■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.74■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.74■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.73■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.72■■■■□ 3.31
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 IFT172Q9UG01 1749 aa35.69■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MST1RQ04912 1400 aa35.68■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.68■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BRINP3Q76B58 766 aa35.68■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 JCADQ9P266 1359 aa35.67■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.66■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HRCP23327 699 aa35.64■■■■□ 3.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PIK3C2GO75747 1445 aa35.6■■■■□ 3.29
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.6■■■■□ 3.29
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TECPR2O15040 1411 aa35.53■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.52■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.52■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.52■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MYOM2P54296 1465 aa35.51■■■■□ 3.28
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.5■■■■□ 3.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ABCC11Q96J66 1382 aa35.5■■■■□ 3.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.49■■■■□ 3.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 STK26Q9P289 416 aa35.48■■■■□ 3.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SHPRHQ149N8 1683 aa35.48■■■■□ 3.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.43■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRP6O75581 1613 aa35.43■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.42■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.41■■■■□ 3.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
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