RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575237.2

CREBBP-211, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene CREBBP, Length 403 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-211ENST00000575237 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.17■■□□□ 1.14
CREBBP-211ENST00000575237 LRP6O75581 1613 aa22.17■■□□□ 1.14
CREBBP-211ENST00000575237 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.16■■□□□ 1.14
CREBBP-211ENST00000575237 DAPK1P53355 1430 aa22.15■■□□□ 1.14
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CREBBP-211ENST00000575237 ZFYVE9O95405 1425 aa22.14■■□□□ 1.14
CREBBP-211ENST00000575237 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.14■■□□□ 1.14
CREBBP-211ENST00000575237 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.14■■□□□ 1.14
CREBBP-211ENST00000575237 BCANQ96GW7 911 aa22.14■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.13■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.11■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.1■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 TRIM52Q96A61 297 aa22.09■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 TBX22Q9Y458 520 aa22.09■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.08■■□□□ 1.13
CREBBP-211ENST00000575237 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 SHPRHQ149N8 1683 aa22.07■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.06■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.06■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 RXRBP28702 533 aa22.04■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.04■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 C14orf37Q86TY3 774 aa22.03■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.02■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CREBBP-211ENST00000575237 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.02■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.01■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 PIK3R4Q99570 1358 aa22.01■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 ATF3P18847 181 aa22.01■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 ADGRL2O95490 1459 aa22.01■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 DIP2AQ14689 1571 aa21.99■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 BRINP3Q76B58 766 aa21.98■■□□□ 1.11
CREBBP-211ENST00000575237 AFF2P51816 1311 aa21.95■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.95■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.94■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 DCCP43146 1447 aa21.93■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.93■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 TRPM2O94759 1503 aa21.9■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.9■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 PTPRUQ92729 1446 aa21.9■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 APLP2Q06481 763 aa21.9■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.9■■□□□ 1.1
CREBBP-211ENST00000575237 RGS12O14924 1447 aa21.89■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.86■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 MST1RQ04912 1400 aa21.86■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 UNC13BO14795 1591 aa21.84■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 E9PCH4 1651 aa21.83■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 C8orf37Q96NL8 207 aa21.83■■□□□ 1.09
CREBBP-211ENST00000575237 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CREBBP-211ENST00000575237 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.82■■□□□ 1.08
CREBBP-211ENST00000575237 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CREBBP-211ENST00000575237 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.79■■□□□ 1.08
CREBBP-211ENST00000575237 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.78■■□□□ 1.08
CREBBP-211ENST00000575237 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CREBBP-211ENST00000575237 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.76■■□□□ 1.07
CREBBP-211ENST00000575237 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.76■■□□□ 1.07
CREBBP-211ENST00000575237 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.75■■□□□ 1.07
CREBBP-211ENST00000575237 NGLY1Q96IV0 654 aa21.75■■□□□ 1.07
CREBBP-211ENST00000575237 EP400Q96L91 3159 aa21.74■■□□□ 1.07
CREBBP-211ENST00000575237 METP08581 1390 aa21.74■■□□□ 1.07
CREBBP-211ENST00000575237 ADAMTS2O95450 1211 aa21.71■■□□□ 1.07
CREBBP-211ENST00000575237 ROCK1Q13464 1354 aa21.7■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 LAMC1P11047 1609 aa21.69■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 NUP155O75694 1391 aa21.69■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.69■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 FOXD1Q16676 465 aa21.68■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.68■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.67■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 USP21Q9UK80 565 aa21.67■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 ATRNO75882 1429 aa21.65■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 PTCH1Q13635 1447 aa21.65■■□□□ 1.06
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CREBBP-211ENST00000575237 CCDC125Q86Z20 511 aa21.61■■□□□ 1.05
CREBBP-211ENST00000575237 ORAI2Q96SN7 254 aa21.6■■□□□ 1.05
CREBBP-211ENST00000575237 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.6■■□□□ 1.05
CREBBP-211ENST00000575237 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.6■■□□□ 1.05
CREBBP-211ENST00000575237 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CREBBP-211ENST00000575237 MYOM2P54296 1465 aa21.57■■□□□ 1.04
CREBBP-211ENST00000575237 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.56■■□□□ 1.04
CREBBP-211ENST00000575237 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.56■■□□□ 1.04
CREBBP-211ENST00000575237 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.56■■□□□ 1.04
CREBBP-211ENST00000575237 CLTCL1P53675 1640 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms