RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.02■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 E9PCH4 1651 aa24.02■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.02■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 BCANQ96GW7 911 aa24.02■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.02■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 ZFYVE9O95405 1425 aa24.01■■□□□ 1.43
NME3-211ENST00000568561 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
NME3-211ENST00000568561 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
NME3-211ENST00000568561 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.99■■□□□ 1.43
NME3-211ENST00000568561 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.98■■□□□ 1.43
NME3-211ENST00000568561 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
NME3-211ENST00000568561 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.97■■□□□ 1.43
NME3-211ENST00000568561 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.95■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 ROCK1Q13464 1354 aa23.91■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 ITGAEP38570 1179 aa23.91■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 MSH6P52701 1360 aa23.91■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
NME3-211ENST00000568561 PHLPP1O60346 1717 aa23.89■■□□□ 1.41
NME3-211ENST00000568561 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.86■■□□□ 1.41
NME3-211ENST00000568561 NUP155O75694 1391 aa23.86■■□□□ 1.41
NME3-211ENST00000568561 DIP2AQ14689 1571 aa23.83■■□□□ 1.41
NME3-211ENST00000568561 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
NME3-211ENST00000568561 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.82■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 SLAIN2Q9P270 581 aa23.82■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.81■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 TBX22Q9Y458 520 aa23.81■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 C14orf37Q86TY3 774 aa23.79■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 TRPM2O94759 1503 aa23.78■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.77■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 POTEAQ6S8J7 498 aa23.77■■□□□ 1.4
NME3-211ENST00000568561 PTPRUQ92729 1446 aa23.75■■□□□ 1.39
NME3-211ENST00000568561 PIK3R4Q99570 1358 aa23.73■■□□□ 1.39
NME3-211ENST00000568561 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.73■■□□□ 1.39
NME3-211ENST00000568561 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
NME3-211ENST00000568561 JCADQ9P266 1359 aa23.72■■□□□ 1.39
NME3-211ENST00000568561 CLTCL1P53675 1640 aa23.72■■□□□ 1.39
NME3-211ENST00000568561 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
NME3-211ENST00000568561 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.7■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.7■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 LRP6O75581 1613 aa23.69■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 ATF3P18847 181 aa23.67■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.67■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.67■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.65■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 SHPRHQ149N8 1683 aa23.65■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 KIF1BO60333 1816 aa23.64■■□□□ 1.38
NME3-211ENST00000568561 METP08581 1390 aa23.63■■□□□ 1.37
NME3-211ENST00000568561 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NME3-211ENST00000568561 NAIPQ13075 1403 aa23.61■■□□□ 1.37
NME3-211ENST00000568561 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.61■■□□□ 1.37
NME3-211ENST00000568561 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.6■■□□□ 1.37
NME3-211ENST00000568561 BRINP3Q76B58 766 aa23.6■■□□□ 1.37
NME3-211ENST00000568561 DCCP43146 1447 aa23.59■■□□□ 1.37
NME3-211ENST00000568561 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.58■■□□□ 1.36
NME3-211ENST00000568561 MST1RQ04912 1400 aa23.58■■□□□ 1.36
NME3-211ENST00000568561 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.58■■□□□ 1.36
NME3-211ENST00000568561 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NME3-211ENST00000568561 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.54■■□□□ 1.36
NME3-211ENST00000568561 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NME3-211ENST00000568561 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NME3-211ENST00000568561 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NME3-211ENST00000568561 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NME3-211ENST00000568561 TRIM52Q96A61 297 aa23.5■■□□□ 1.35
NME3-211ENST00000568561 PPLO60437 1756 aa23.49■■□□□ 1.35
NME3-211ENST00000568561 HFM1A2PYH4 1435 aa23.49■■□□□ 1.35
NME3-211ENST00000568561 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.47■■□□□ 1.35
NME3-211ENST00000568561 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NME3-211ENST00000568561 PTCH1Q13635 1447 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-211ENST00000568561 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-211ENST00000568561 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NME3-211ENST00000568561 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.43■■□□□ 1.34
NME3-211ENST00000568561 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.41■■□□□ 1.34
NME3-211ENST00000568561 AFF2P51816 1311 aa23.4■■□□□ 1.34
NME3-211ENST00000568561 FOXD1Q16676 465 aa23.4■■□□□ 1.34
NME3-211ENST00000568561 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 LAMC1P11047 1609 aa23.38■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 RXRBP28702 533 aa23.36■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 C8orf37Q96NL8 207 aa23.36■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.35■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 ORAI2Q96SN7 254 aa23.35■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.34■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 IFT172Q9UG01 1749 aa23.33■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
NME3-211ENST00000568561 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NME3-211ENST00000568561 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.31■■□□□ 1.32
NME3-211ENST00000568561 ADAMTS2O95450 1211 aa23.3■■□□□ 1.32
NME3-211ENST00000568561 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.3■■□□□ 1.32
NME3-211ENST00000568561 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.29■■□□□ 1.32
NME3-211ENST00000568561 RGS12O14924 1447 aa23.29■■□□□ 1.32
NME3-211ENST00000568561 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
NME3-211ENST00000568561 RGL3Q3MIN7 710 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms