RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
E2F4-210ENST00000568485 ROCK1Q13464 1354 aa34.07■■■■□ 3.04
E2F4-210ENST00000568485 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
E2F4-210ENST00000568485 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.05■■■■□ 3.04
E2F4-210ENST00000568485 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.03■■■■□ 3.04
E2F4-210ENST00000568485 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
E2F4-210ENST00000568485 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.03■■■■□ 3.04
E2F4-210ENST00000568485 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.02■■■■□ 3.04
E2F4-210ENST00000568485 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
E2F4-210ENST00000568485 E9PCH4 1651 aa34■■■■□ 3.03
E2F4-210ENST00000568485 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.98■■■■□ 3.03
E2F4-210ENST00000568485 BCANQ96GW7 911 aa33.97■■■■□ 3.03
E2F4-210ENST00000568485 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa33.94■■■■□ 3.02
E2F4-210ENST00000568485 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
E2F4-210ENST00000568485 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
E2F4-210ENST00000568485 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
E2F4-210ENST00000568485 MSH6P52701 1360 aa33.9■■■■□ 3.02
E2F4-210ENST00000568485 TBX22Q9Y458 520 aa33.89■■■■□ 3.02
E2F4-210ENST00000568485 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa33.88■■■■□ 3.01
E2F4-210ENST00000568485 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP33.88■■■■□ 3.01
E2F4-210ENST00000568485 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
E2F4-210ENST00000568485 NUP155O75694 1391 aa33.87■■■■□ 3.01
E2F4-210ENST00000568485 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
E2F4-210ENST00000568485 ITGAEP38570 1179 aa33.83■■■■□ 3.01
E2F4-210ENST00000568485 DIP2AQ14689 1571 aa33.83■■■■□ 3.01
E2F4-210ENST00000568485 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
E2F4-210ENST00000568485 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa33.81■■■■□ 3
E2F4-210ENST00000568485 SLAIN2Q9P270 581 aa33.81■■■■□ 3
E2F4-210ENST00000568485 PIK3R4Q99570 1358 aa33.78■■■■□ 3
E2F4-210ENST00000568485 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
E2F4-210ENST00000568485 PHLPP1O60346 1717 aa33.72■■■□□ 2.99
E2F4-210ENST00000568485 TRPM2O94759 1503 aa33.71■■■□□ 2.99
E2F4-210ENST00000568485 PTPRUQ92729 1446 aa33.7■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.69■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 JCADQ9P266 1359 aa33.67■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa33.67■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 POTEAQ6S8J7 498 aa33.66■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa33.65■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 C14orf37Q86TY3 774 aa33.65■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 C19orf44Q9H6X5 657 aa33.65■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa33.64■■■□□ 2.98
E2F4-210ENST00000568485 CADPS2Q86UW7 1296 aa33.63■■■□□ 2.97
E2F4-210ENST00000568485 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
E2F4-210ENST00000568485 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
E2F4-210ENST00000568485 ATF3P18847 181 aa33.58■■■□□ 2.97
E2F4-210ENST00000568485 NAIPQ13075 1403 aa33.58■■■□□ 2.97
E2F4-210ENST00000568485 CLTCL1P53675 1640 aa33.57■■■□□ 2.96
E2F4-210ENST00000568485 DCCP43146 1447 aa33.54■■■□□ 2.96
E2F4-210ENST00000568485 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa33.54■■■□□ 2.96
E2F4-210ENST00000568485 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
E2F4-210ENST00000568485 METP08581 1390 aa33.53■■■□□ 2.96
E2F4-210ENST00000568485 LRP6O75581 1613 aa33.52■■■□□ 2.96
E2F4-210ENST00000568485 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.5■■■□□ 2.95
E2F4-210ENST00000568485 BRINP3Q76B58 766 aa33.49■■■□□ 2.95
E2F4-210ENST00000568485 SHPRHQ149N8 1683 aa33.46■■■□□ 2.95
E2F4-210ENST00000568485 MST1RQ04912 1400 aa33.45■■■□□ 2.94
E2F4-210ENST00000568485 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa33.43■■■□□ 2.94
E2F4-210ENST00000568485 HFM1A2PYH4 1435 aa33.43■■■□□ 2.94
E2F4-210ENST00000568485 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa33.41■■■□□ 2.94
E2F4-210ENST00000568485 KIF1BO60333 1816 aa33.4■■■□□ 2.94
E2F4-210ENST00000568485 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.36■■■□□ 2.93
E2F4-210ENST00000568485 NHSL1Q5SYE7 1610 aa33.35■■■□□ 2.93
E2F4-210ENST00000568485 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
E2F4-210ENST00000568485 NALCNQ8IZF0 1738 aa33.35■■■□□ 2.93
E2F4-210ENST00000568485 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
E2F4-210ENST00000568485 TRIM52Q96A61 297 aa33.33■■■□□ 2.93
E2F4-210ENST00000568485 PTCH1Q13635 1447 aa33.31■■■□□ 2.92
E2F4-210ENST00000568485 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
E2F4-210ENST00000568485 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
E2F4-210ENST00000568485 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.28■■■□□ 2.92
E2F4-210ENST00000568485 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
E2F4-210ENST00000568485 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.27■■■□□ 2.92
E2F4-210ENST00000568485 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.25■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 C1orf167Q5SNV9 1468 aa33.24■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 PPLO60437 1756 aa33.21■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.21■■■□□ 2.91
E2F4-210ENST00000568485 LAMC1P11047 1609 aa33.18■■■□□ 2.9
E2F4-210ENST00000568485 FOXD1Q16676 465 aa33.16■■■□□ 2.9
E2F4-210ENST00000568485 AFF2P51816 1311 aa33.15■■■□□ 2.9
E2F4-210ENST00000568485 RXRBP28702 533 aa33.12■■■□□ 2.89
E2F4-210ENST00000568485 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
E2F4-210ENST00000568485 ORAI2Q96SN7 254 aa33.11■■■□□ 2.89
E2F4-210ENST00000568485 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
E2F4-210ENST00000568485 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.09■■■□□ 2.89
E2F4-210ENST00000568485 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.09■■■□□ 2.89
E2F4-210ENST00000568485 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.07■■■□□ 2.88
E2F4-210ENST00000568485 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.07■■■□□ 2.88
E2F4-210ENST00000568485 C8orf37Q96NL8 207 aa33.06■■■□□ 2.88
E2F4-210ENST00000568485 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa33.04■■■□□ 2.88
E2F4-210ENST00000568485 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.03■■■□□ 2.88
E2F4-210ENST00000568485 IFT172Q9UG01 1749 aa33.02■■■□□ 2.88
E2F4-210ENST00000568485 TECPR2O15040 1411 aa33.02■■■□□ 2.88
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