RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.55■■■■□ 3.12
PPP4C-212ENST00000567828 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.55■■■■□ 3.12
PPP4C-212ENST00000567828 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
PPP4C-212ENST00000567828 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
PPP4C-212ENST00000567828 HSPA1LP34931 641 aa34.51■■■■□ 3.12
PPP4C-212ENST00000567828 NWD1Q149M9 1564 aa34.5■■■■□ 3.11
PPP4C-212ENST00000567828 NAIPQ13075 1403 aa34.5■■■■□ 3.11
PPP4C-212ENST00000567828 BCANQ96GW7 911 aa34.49■■■■□ 3.11
PPP4C-212ENST00000567828 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
PPP4C-212ENST00000567828 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.48■■■■□ 3.11
PPP4C-212ENST00000567828 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
PPP4C-212ENST00000567828 KCNA6P17658 529 aa34.45■■■■□ 3.11
PPP4C-212ENST00000567828 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
PPP4C-212ENST00000567828 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM94Q12767 1356 aa34.4■■■■□ 3.1
PPP4C-212ENST00000567828 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
PPP4C-212ENST00000567828 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 HFM1A2PYH4 1435 aa34.38■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 CLTCL1P53675 1640 aa34.37■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 ILDR2Q71H61 639 aa34.36■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 DIP2AQ14689 1571 aa34.35■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 KIF1BO60333 1816 aa34.34■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
PPP4C-212ENST00000567828 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.32■■■■□ 3.08
PPP4C-212ENST00000567828 TRPM2O94759 1503 aa34.32■■■■□ 3.08
PPP4C-212ENST00000567828 TBX22Q9Y458 520 aa34.28■■■■□ 3.08
PPP4C-212ENST00000567828 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.27■■■■□ 3.08
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM52Q96A61 297 aa34.26■■■■□ 3.08
PPP4C-212ENST00000567828 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.25■■■■□ 3.07
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
PPP4C-212ENST00000567828 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.2■■■■□ 3.07
PPP4C-212ENST00000567828 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.2■■■■□ 3.07
PPP4C-212ENST00000567828 MSH6P52701 1360 aa34.2■■■■□ 3.07
PPP4C-212ENST00000567828 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.19■■■■□ 3.06
PPP4C-212ENST00000567828 PIK3R4Q99570 1358 aa34.18■■■■□ 3.06
PPP4C-212ENST00000567828 PTPRUQ92729 1446 aa34.14■■■■□ 3.06
PPP4C-212ENST00000567828 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PPP4C-212ENST00000567828 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PPP4C-212ENST00000567828 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PPP4C-212ENST00000567828 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.09■■■■□ 3.05
PPP4C-212ENST00000567828 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.08■■■■□ 3.05
PPP4C-212ENST00000567828 PHLPP1O60346 1717 aa34.07■■■■□ 3.05
PPP4C-212ENST00000567828 PPLO60437 1756 aa34.07■■■■□ 3.04
PPP4C-212ENST00000567828 C14orf37Q86TY3 774 aa34.06■■■■□ 3.04
PPP4C-212ENST00000567828 SOCS7O14512 581 aa34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-212ENST00000567828 SLAIN2Q9P270 581 aa34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-212ENST00000567828 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-212ENST00000567828 METP08581 1390 aa34.03■■■■□ 3.04
PPP4C-212ENST00000567828 FOXD1Q16676 465 aa34.03■■■■□ 3.04
PPP4C-212ENST00000567828 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
PPP4C-212ENST00000567828 C19orf44Q9H6X5 657 aa33.96■■■■□ 3.03
PPP4C-212ENST00000567828 NALCNQ8IZF0 1738 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 ATF3P18847 181 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 CADPS2Q86UW7 1296 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 IFT172Q9UG01 1749 aa33.91■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.91■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.9■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.9■■■■□ 3.02
PPP4C-212ENST00000567828 DCCP43146 1447 aa33.88■■■■□ 3.01
PPP4C-212ENST00000567828 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.88■■■■□ 3.01
PPP4C-212ENST00000567828 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
PPP4C-212ENST00000567828 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa33.83■■■■□ 3.01
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.82■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 MST1RQ04912 1400 aa33.79■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 PTCH1Q13635 1447 aa33.79■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 JCADQ9P266 1359 aa33.79■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 RGL3Q3MIN7 710 aa33.78■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa33.78■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.77■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 BRINP3Q76B58 766 aa33.77■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 NHSL1Q5SYE7 1610 aa33.77■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 SHPRHQ149N8 1683 aa33.77■■■■□ 3
PPP4C-212ENST00000567828 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.75■■■□□ 2.99
PPP4C-212ENST00000567828 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.74■■■□□ 2.99
PPP4C-212ENST00000567828 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
PPP4C-212ENST00000567828 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.73■■■□□ 2.99
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.7■■■□□ 2.98
PPP4C-212ENST00000567828 LRP6O75581 1613 aa33.66■■■□□ 2.98
PPP4C-212ENST00000567828 KNDC1Q76NI1 1749 aa33.65■■■□□ 2.98
PPP4C-212ENST00000567828 PIK3C2GO75747 1445 aa33.63■■■□□ 2.97
PPP4C-212ENST00000567828 C1orf167Q5SNV9 1468 aa33.62■■■□□ 2.97
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.6■■■□□ 2.97
PPP4C-212ENST00000567828 POTEAQ6S8J7 498 aa33.59■■■□□ 2.97
PPP4C-212ENST00000567828 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
PPP4C-212ENST00000567828 LAMC1P11047 1609 aa33.57■■■□□ 2.97
PPP4C-212ENST00000567828 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa33.57■■■□□ 2.96
PPP4C-212ENST00000567828 TECPR2O15040 1411 aa33.56■■■□□ 2.96
PPP4C-212ENST00000567828 STK26Q9P289 416 aa33.56■■■□□ 2.96
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.54■■■□□ 2.96
PPP4C-212ENST00000567828 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
PPP4C-212ENST00000567828 MYOM2P54296 1465 aa33.54■■■□□ 2.96
PPP4C-212ENST00000567828 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.53■■■□□ 2.96
PPP4C-212ENST00000567828 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
PPP4C-212ENST00000567828 ORAI2Q96SN7 254 aa33.5■■■□□ 2.95
PPP4C-212ENST00000567828 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms