RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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USP3-AS1-204ENST00000559861 NBPF3Q9H094 633 aa16.75■□□□□ 0.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMAPO00193 183 aa16.71■□□□□ 0.27
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.7■□□□□ 0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHOX2BQ99453 314 aa16.7■□□□□ 0.26
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
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USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM66O15016 1216 aa16.69■□□□□ 0.26
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USP3-AS1-204ENST00000559861 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMUB1Q9BVT8 246 aa16.55■□□□□ 0.24
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USP3-AS1-204ENST00000559861 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.53■□□□□ 0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.53■□□□□ 0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.53■□□□□ 0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.53■□□□□ 0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
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USP3-AS1-204ENST00000559861 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.52■□□□□ 0.24
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USP3-AS1-204ENST00000559861 WIZO95785 1651 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 WNT2BQ93097 391 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRCH3Q96II8 777 aa16.47■□□□□ 0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.47■□□□□ 0.23
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USP3-AS1-204ENST00000559861 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.46■□□□□ 0.23
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USP3-AS1-204ENST00000559861 NEUROD2Q15784 382 aa16.44■□□□□ 0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLF2Q8IX21 1173 aa16.43■□□□□ 0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC4A3P48751 1232 aa16.42■□□□□ 0.22
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USP3-AS1-204ENST00000559861 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.41■□□□□ 0.22
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USP3-AS1-204ENST00000559861 THSD4Q6ZMP0 1018 aa16.39■□□□□ 0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRDM2Q13029 1718 aa16.39■□□□□ 0.21
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USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF40O75150 1001 aa16.36■□□□□ 0.21
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USP3-AS1-204ENST00000559861 CD46P15529 392 aa16.35■□□□□ 0.21
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USP3-AS1-204ENST00000559861 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.35■□□□□ 0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
USP3-AS1-204ENST00000559861 NECTIN2Q92692 538 aa16.33■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 RDH13Q8NBN7 331 aa16.32■□□□□ 0.2
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USP3-AS1-204ENST00000559861 MMRN1Q13201 1228 aa16.3■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.3■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.3■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.3■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 WBP1LQ9NX94 342 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM117AQ9C073 453 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFHP08603 1231 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 GCGRP47871 477 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPN5P54829 565 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDRGK1Q96HY6 314 aa16.24■□□□□ 0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.22■□□□□ 0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.22■□□□□ 0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 APLP1P51693 650 aa16.21■□□□□ 0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRR14Q9BWN1 585 aa16.21■□□□□ 0.19
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.19■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 HCSTQ9UBK5 93 aa16.19■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 KDM4AO75164 1064 aa16.18■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGEF11O15085 1522 aa16.18■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL27Q8NEV9 243 aa16.17■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP46P62068 366 aa16.16■□□□□ 0.18
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.16■□□□□ 0.18
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